Бактеріальні фактори вірулентності і варіанти їх застосування

1. Композиція, яка містить: a) поліпептид, який включає амінокислотну послідовність, по суті ідентичну послідовності SEQ ID NO: 22-24 або її фрагменту, або варіанту, b) молекулу нуклеїнової кислоти, яка кодує поліпептид, який включає амінокислотну послідовність, по суті ідентичну послідовності SEQ ID NO: 22-24 або її фрагменту, або варіанту, c) молекулу нуклеїнової кислоти, яка включає нуклеотидну послідовність, по суті ідентичну послідовності SEQ ID NO: 1-3 або її фрагменту, або варіанту, UA (21) a200605985 (22) 29.10.2004 (24) 26.04.2011 (86) PCT/CA2004/001891, 29.10.2004 (31) 60/515,703 (32) 31.10.2003 (33) US (46) 26.04.2011, Бюл.№ 8, 2011 р. (72) ФІНЛЕЙ БРЕТТ, CA, ГРЮНХЕЙД САМАНТА, CA, ДЕН ВАНЬІНЬ, CA, ВАЛЛАНС БРЮС, CA, ПУЕНТЕ ХОСЕ Л., MX (73) ДЗЕ ЮНІВЕРСІТІ ОФ БРІТІШ КОЛАМБІА, CA, УНІВЕРСІДАД НАСЬОНАЛЬ АУТОНОМА ДЕ МЕКСІКО, MX (56) DENG WANYIN ET AL: "Citrobacter rodentium translocated intimin receptor (Tir) is an essential virulence factor needed for actin condensation, intestinal colonization and colonic hyperplasia in mice." MOLECULAR MICROBIOLOGY APR 2003, vol. 48, no. 1, April 2003 (2003-04), pages 95-115. ABE A ET AL: "Two enteropathogenic Escherichia coli type III secreted proteins, EspA and EspB, are virulence factors." THE JOURNAL OF EXPERIMENTAL MEDICINE 16 NOV 1998, vol. 188, no. 10, 16 November 1998 (1998-11-16), pages 1907-1916. US6365723 B; 02.04.02. JP2002355074 A2, 24.01.02. WO02053181 A1, 11.07.02. DENG W. ET AL: 'Dissecting virulence; Systematic anf functional analyses of a pathogenicity island' PNAS vol. 101, no. 10, March 2004, pages 3597 3602. GRUENHEID S. ET AL: 'Identification and characterization of NleA, a non-LEE-encoded type III translocated virulence factor of enterohaemorrhagic 2 (19) 1 3 94206 4 d) надосадову рідину клітинної культури, яка включає поліпептид, що містить амінокислотну послідовність, по суті ідентичну послідовності SEQ ID NO: 22-24 або її фрагменту, або варіанту, e) бактерію або її препарат, де бактерія включає в себе мутацію в бактерійному геномі в нуклеотидній послідовності, яка, по суті, ідентична SEQ ID NO: 1-3, або f) бактерію або її препарат, де бактерія включає в себе мутацію в гені, по суті, ідентичному NleA або її гомологам, у сполученні з фізіологічно прийнятним носієм, де NleA являє собою фактор вірулентності або кодує фактор вірулентності. 2. Композиція за п. 1, в якій поліпептид становить 20 % клітинного білка, присутнього в композиції, що містить надосадову рідину клітинної культури. 3. Композиція за п. 1, яка додатково містить EspA, EspB, EspD, EspP, Tir, шигатоксин 1, шигатоксин 2 або поліпептид інтимін. 4. Композиція за п. 1, в якій бактерія являє собою ентерогеморагічну Е. соlі (ЕНЕС), ентеропатогенну Е. соІі (ЕРЕС) або Citrobacter rodentium. 5. Композиція за п. 4, де ЕНЕС являє собою ЕНЕС 0157:Н7 або ЕНЕС 0157:NM; або де ЕРЕС являє собою ЕРЕС 0127:Н6. 6. Композиція за п. 1, в якій бактерія є живою і призначена для перорального введення. 7. Композиція за п. 1, в якій бактерія є убитою і призначена для парентерального введення. 8. Композиція за п.1, яка додатково містить ад'ювант. 9. Композиція за п. 8, в якій ад'ювант являє собою емульсію "масло у воді" або емульсію, що не являє собою "масло у воді". 10. Композиція за п. 9, в якій емульсія "масло у воді" являє собою EMULSIGEN™ або EMULSIGENPLUS™. 11. Композиція за п. 8, в якій ад'ювант являє собою мінеральне масло або диметилдіоктадециламонію бромід або містить і мінеральне масло, і диметилдіоктадециламонію бромід. 12. Композиція за п. 8, в якій ад'ювант включає один або декілька агентів, вибраних з групи, яка складається з емульгуючого засобу, мурамілдипептиду, засобу на водній основі, засобу, основаному на хітозані, сапоніну, масла, ліпополісахариду, екстракту бактерійної клітинної стінки, бактерійної ДНК, бактерійного комплексу, синтетичного олігонуклеотиду і аліфатичної азотистої основи. 13. Композиція за п. 12, в якій масло являє собою Amphigen®. 14. Композиція за п. 8, в якій ад'ювант включає екстракт клітинної стінки мікобактерії, ДНК мікобактерії або комплекс клітинної стінки мікобактерії. 15. Композиція за п. 8, де ад'ювант присутній в композиції в концентрації від 20 % до 40 % (об./об.). 16. Застосування композиції за будь-яким з пп. 115 для отримання лікарського засобу для: (і) індукції імунної відповіді у тварини проти А/Епатогену або його компонента, (іі) зниження виділення або колонізації А/Епатогену у тварини, або (ііі) лікування або профілактики інфекції, що викликається А/Е-патогеном, у тварини. 17. Застосування за п. 16, в якому тварина є жуйною або являє собою людину. 18. Застосування за п. 17, в якому жуйна тварина являє собою особину великої рогатої худоби або особину вівці. 19. Застосування за п. 16, в якому А/Е-патоген являє собою ентерогеморагічну Е. соІі (ЕНЕС), ентеропатогенну Е. соІі (ЕРЕС) або Citrobacter rodentium. 20. Застосування за п. 19, в якому ЕНЕС являє собою ЕНЕС 0157:Н7 або ЕНЕС 0157: NM; або в якому ЕРЕС являє собою ЕРЕС 0127:Н6. 21. Спосіб ослаблення вірулентності А/Е-патогену, що включає мутування одного або декількох генів, вибраних з групи, яка складається з nІеА або її гомологів в А/Е-патогені, або мутування однієї або декількох нуклеотидних послідовностей в геномі А/Е-патогену, в якому нуклеотидна послідовність вибрана з SEQ ID NO: 1-3. 22. Рекомбінантний поліпептид, що включає амінокислотну послідовність, по суті ідентичну послідовності SEQ ID NO: 22-24. 23. Виділена молекула нуклеїнової кислоти, що включає нуклеотидну послідовність, по суті ідентичну послідовності SEQ ID NO: 1-3. 24. Виділена молекула нуклеїнової кислоти за п. 23, де вказана виділена молекула нуклеїнової кислоти включена у вектор. 25. Виділена молекула нуклеїнової кислоти за п. 23, де вказаний вектор включений в клітинухазяїна. Винахід відноситься до бактеріальних патогенів. Більш конкретно, винахід частково відноситься до білків, що секретуються, бактеріальних патогенів і способів їх застосування. Escherichia coli являє собою виключно мінливий організм. На додаток до того, що вона є представником нормальної кишкової флори, штами Е. coli можуть також викликати інфекції сечового міхура, менінгіт і діарею. Е. coli, що викликають діарею, включають, щонайменше, п'ять типів Е. coli, які викликають різні симптоми, що варіюють від холероподібної діареї до гострого коліту. Кожний тип Е. coli, що викликають діарею, володіє конкретним набором факторів вірулентності, включаючи адгезини, інвазини і/або токсини, які відповідають за індукцію конкретного типу діареї. Ентеропатогенна Е. coli (EPEC) являє собою переважну причину дитячої діареї у всьому світі. Захворювання ЕРЕС характеризується водянистою діареєю різної тяжкості, з блювотою і пропасницею, що часто супроводжуються втратою рідини. На додаток до окремих спалахів у денних 5 медичних і дитячих установах у країнах, що розвиваються, ЕРЕС представляє серйозну загрозу здоров'ю немовлят (