Спосіб одержання людської мnо2-дисмутази
Номер патенту: 19318
Опубліковано: 25.12.1997
Автори: Крістіан Стратова, Марія Йозефа Віхе-Кастанон, Андреас Цефель, Едельтрауд Кристек, Вальтер Спевак, Елінборг Остерманн, Рудольф Гауптманн, Конрад Хекль, Інгрід Маурер-Фогі
Формула / Реферат
Способ получения человеческой МnО2-дисмутазы, заключающийся в том, что из плацентарной или печеночной ткани человека выделяют мРНК, получают поли(А)+РНК, синтезируют двунитевую кДНК, конструируют генбанк кДНК, далее выделяют последовательность ДНК, кодирующую Мn2О-дисмутазу, при помощи зондов:
или последовательности кДНК гена MnO2-дисмутазы человека, последовательность ДНК достраивают до стартового кодона или стоп-кодона, непосредственно за стартовым кодоном гена размещают митохондриальную лидерную или сигнальную последовательность ДНК MnO2-дисмутазы S. cerevisiae или человека, затем последовательность ДНК, кодирующую MnO2-дисмутазу, используют для конструирования вектора экспрессии, состоящего из промоторов ADHI или ADHII, пар олигонуклеотидов ЕВI 1161/EВІ 1164 + ЕВI 1167/ЕВІ 1160 формулы
или CVP1, сигнала инициирования, митохондриальной лидерной или сигнальной последовательности Saccharomyces cerevisiae или человека, стоп-кодона и терминатора ADHII, далее конструируют плазмиду PWS550A, или PWS490A, или pWS491 А, или PWS371A, или pWS372A, или pWS373A, или рЕ024 - АВ, или рЕ025-АС, или рЕ026 - AD, или рЕ040, или рЕ041, или рЕ042, или рЕ043, или рЕ044, или рЕ045, или рЕ050, или рЕ051, которой трансформируют штамму Saccharomyces cerevisiae, или плазмиду pSV2dhfrSOD1 или pSV2dhfrSOD2, которой трансформируют штаммы культивируемых клеток, культивируют трансформированные клетки, выделяют и очищают целевой продукт путем экстракции, осаждения и хроматографии.
Текст
Изобретение относится к биотехнологии и генетической инженерии, в частности к способам получения человеческой MnO2-дисмутазы для. терапевтических целей, например, в качестве антивоспалительного средства. Способ заключается в том, что из плацентарной или печеночной ткани человека выделяют мРНК, получают поли (А)+РНК, синтезируют двунитевую кДНК, конструируют банк кДНК, выделяют последовательность ДНК, кодирующую Мn 2О-дисмутаз у, при помощи зондов и или последовательности кДНК гена MnO2-Дисмутазы человека, последовательность ДНК достраивают до стартового кодона или стоп-кодона, непосредственно за стартовым кодоном гена размещают митохондриальную лидерную или сигнальную последовательность ДНК MnO2-дисмутазы S.cerevisiae или человека, последовательность ДНК, кодирующую МnО2-дисмутазу, используют для конструирования вектора экспрессии, состоящего из промоторов ADHI ADHII, пар олигонуклеотидов EBI 1161/EBI 1164 +EBI 1167/EBI 1160 формулы или CUP1, сигнала инициирования, митохондриальной лидерной или сигнальной последовательности Saccharomyces cerevisiae или человека, стоп-кодона и терминатора ADHII, полученными векторами экспрессии pWS550A, или pWS490A, или pWS491A, или PWS371A, или pWS373A, или рЕ024 - АВ, или рЕ025 АС, или рЕ026 - AD, или рЕ040, или рЕ041, или рЕ042, или рЕ043, или рЕ044, или рЕ045, или рЕ050, или рЕ051 трансформируют штаммы Saccharomyces cerevisiae или плазмиду pSV2 dhf r SOD1 или pSV2 dhfr, которой трансформируют штаммы культивируемых клеток, культивируют трансформированные клетки, выделяют и очищают целевой продукт путем экстракции, осаждения и хроматографии. При осуществлении предлагаемого способа используют промотор ADHI (pES103), регистрационный номер DSN 4013 (фрагмент Bam Hl/Xhol с длиной 1500 п. о. (пар оснований); ускоренный промотор ADHI, регистрационный номер DSM 4016(pWS 323E) (фрагмент Bam Hl/Xho I с длиной 400 п.о.); терминатор AIHII (pGD2), регистрационный номер DSM 4014, (фрагмент Xba l/Hind. Ill с длиной 336 п. о.); буфер Bam HI: 150мМ NaCI, 6мМ трис-НСІ, рН 7,9,6мМ МgСІ2, 100 мкл/мл альбумина сыворотки крупного рогатого скота (АСКРС); буфер Коре: 50мМ трис-HCl, рН 8,0, 10мМ MgCI2, 50мМ NaCI; раствор денатурации: 0,5 Μ NaOH. 1,5 Μ NaСІ; раствор Денхардта (50х):1 г поливинил-пирролидона с мол. массой 360000, 1 г фиколла, 1 г АСКРС, Н2О до 100 мл; Е.соli С 600: F-, sup E44, thil, thrl, leuB6, Lac Y1, ton Α21 l ATCC 33724); Е.соli IМ 101: sup Ε, thi D(Іас-рrо АВ), F-, tra D36, pro AB, Iac 1 Ζ, D15; буфер X: 10 мМ NaCI, 50мМ трис-НСІ, рН 7,5. 10 мМ MgCl 2, 1мМ ди тиотриетола (ДТТ); буфер Y: 10 мМ трис-НСІ, рН 7,5, 60мМ NaCI, 10мМ МgСІ2, 1мМ 2-меркаптоэтанола, 100 мкг/мл АСКРС; раствор гибридизации соответствует раствор у предварительной гибридизации, но без ДНК из спермы лосося; содержащий фрагмент Кленова реакционный раствор 22 мкл ДНК/Н 2О, 2,5 мкл 10 буфера НТР (0,5 Μ трис-НСІ, рН 7,2, 0,1 Μ MgSO 4, 1 мМ ДТТ, 500 мкл) (мл АСКРС) по 1 мкл 2мМ dATP, sCTP, dTTP, 2,5 ед. фрагмента Кленова (0,5 мкл); l-буфер: 100мМ трис, рН 7,5, 10мМ МgСІ2, 1мМ этилендинитрилотетрауксусной кислоты ЭДТУК); агар ЛБ: жидкая среда ЛБ, 15 г/л бакто-агара; жидкая среда ЛБ: 10 г/б бактотриптона, 5 г/л дрожжевого экстракта, 5 г/л NaCI, 10 Μ NaOH до рН 7.4; раствор лигирования: 66мМ трис-НСІ, рН 7,6.10мМ MgCl2, 5мМ ДТТ, 1мМ АТР, 1 ед. Т4-ДНК-лигазы; раствор нейтрализации: 0,5 Μ трис-НСІ, рН 7,50, 1,5 Μ NaCI; буфер z: 50мМ KCI, 50мМ NaCl, 50мМ трис-НСІ, рН 8,0,10мМ МgСІ2; раствор предварительной гибридизации: 5 x буфер SSC, 5 x раствор Денхардта, 50мМ натрийфосфа тного буфера, рН 6,8, 1мМ Na2P 4O7 , 100 мкМ АТР, 0,1% додецил-сульфата натрия (ДСП), 30-100 (50) мкг/мл денатурированной обработанной ультразвуком ДНК из спермы лосося; pURA3 регистрационный номер ISM 4015; S. cerevisiae DBY47: a, leu 2, his 3, trpl Ura 3; среда СЦ-УРА: 0,67% BYNB (Dlfco), 2% глюкозы, 2% 50 x смеси аминокислот (г/л): гистидин 1; лейцин 6; триптофан 2,5; лизин 4; аденин 1,2; аргинин 2; метионин 1, фенилаланин 6; треонин 5; изолейцин 6; буфер Sma I: 10мМ трис-НСІ, рН 8,0,20мМ КСІ, 10 мМ МgСІ2, 10 мМ 2-меркаптоэтанола, 100 мкг/мл АСКРС; буфер Sph I: 10мМ трис-НСІ, рН 7,5,100мМ NaCI, 10мМ МgСІ2, 10 мМ 2-меркаптоэтанола, 100 мкг/мл АСКРС; SSC (20х): 3,0 Μ NaCI, 0,3 Μ Na3-цитрата, рН 7,0; SSPE (20х): 3,6 Μ NaCI, 0,2 Μ Na2НРO4 , 20мМ ЭДТУК, NaOH (10 н.) до рН 7,4; буфер ТЕ: 10 мМ трис-НСІ, рН 8,0,1 мМ ЭДТУК; буфер Tha I: 50 мМ трис-НСІ, рН 8,0, 10 мМ МgСІ2 ; τοп-агароза: жидкая среда ЛБ, 0,7% агарозы; раствор предварительной промывки: 1М NaCl, 50мМ трис-НСІ, рН 8,0, 1мМ ЭДТУК, 0.1% ДСН. Пример 1. Конструирование генобанка кДНК. Свежую человеческую плаценту подвергают быстрому замораживанию в жидком азоте, растирают в порошок при температуре ниже -80 С, экстрагируют РНК, из которой получают поли (А)+РНК. Синтезируют ДНК, клонируют ее в EcoRI l gt10, используя Е.соli С600. Титр кДНК фагов l gt 10 составляет 1,2 x 1010 бляшкообразующи х ед. мл, число независимых клонов 1 x 10. Пример 2. Амплификация генобанка l gt 10. Штамм-реципиент E.coli (например, С 600, Генотип F-, E44, sup E44, thill, thrl, leu B6, Lac YI, ton A21 l выращивают при 37°С в течение ночи в среде ЛБ, содержащей 0,2% мальтозы. Культуру центрифугируют и суспендируют в 10мМ раствора сульфата магния до оптической плотности 4,0 при 600 нм. Полученные Mg-клетки хранят при 4°С. Клетки смешивают с суспензией фагов (по 50000 бляшкообразующи х единиц генобанка ДНК на пластину) и инкубируют в течение 20 мин при 37°С. Затем добавляют расплавленную и доведенную до 42°С топ-агарозу (содержащую 10мМ сульфа та магния), смешивают, выливают на предварительно нагретые ЛБ-агаровые пластинки (диаметром 13,5 см), содержащие 10мМ сульфа та магния, и инкубируют в течение 6-12 ч при 37°С. Пример 3. Первичный скрининг для идентификации рекомбинантных l-фагов. а) Обработка нитроцеллюлозных фильтров. Пластинки по окончании инкубации охлаждают до 4°С. Нитроцеллюлозные фильтры кладут на поверхность пластинок. Через 1 мин после пропитки фильтры осторожно удаляют, кладут в раствор денатуратора и инкубируют в течение одной минуты при комнатной температуре. Нейтрализацию осуществляют в растворе нейтрализатора в течение 5 мин при комнатной температуре, затем инкубируют в течение 30 с в буфере 2 x SSPE при той же температуре. С пластины изготовляют копии. Фильтры высушивают, ДНК фиксируют при 80°С. б) Получение 32р-маркированных зондов ДНК. Синтез олигонуклеотидов проводят на синтезаторе 381 А. Олигонуклеотиды очищают электрофорезом в полиакриламидном геле (20% в 8 Μ мочевине) с последующим обессоливанием на Сефадексе G-50. Синтезированные таким образом ДНК-зонды комплементарны последовательностям оснований РНК, кодирующим аминокислоты 39-46(а) и 200-207(6): Они имеют следующие последовательности оснований: в) Гибридизация In situ. С целью удаления с нитроцеллюлозы остатков агарозы и бактерий фильтры инкубируют в растворе предварительной промывки при 65°С в течение нескольких часов при перемешивании. Фильтры инкубируют в течение 1-12 ч при температуре 37°С в растворе предварительной гибридизации, который подвергают предварительной вакуумной дегазации. Используемые для гибридизации радиоактивно меченные ДНК-зонды (около 1 х 10 9 срм/мкг) добавляют к нагретому до 37°С и дегазированному раствору гибридизации. Для поддержания на высоком уровне концентрации ДНК в растворе гибридизации используют минимальное количество жидкости. Гибридизацию осуществляют в течение 12-18 4 при 37°С. Нитроцеллюлозные фильтры три раза промывают в буфере 6 х SSC и 0,05% ДСН (4°С), два раза в течение 30 мин при 4°С, а также в свежеприготовленном растворе, содержащем 3 Μ хлорида тетраметиламмония, 50мМ трис-HCI, рН 8,22мМ ЭДТУК и 0,05% ДСН следующим образом: три раза при комнатной температуре, два раза в течение 30 мин при комнатной температуре и три раза в течение 30 мин при 49°С, после чего сушат на воздухе. Рентгеновскую пленку экспонируют в течение 2-8 дней при - 70°С. Пример 4. Очистка бляшек. После проявления авторадиограмм из агаровой пластинки выделяют те участки, которые дают положительный сигнал гибридизации на обоих нитроцеллюлозных фильтрах. Для этого желаемое место удаляют из агара и переводят в 0,3-0,6 мл l-буфера. Добавляют по одной капле хлороформа, фагам дают диффундировать из агара в течение ночи при 4°С и каждую отдельную фаговую суспензию в виде нескольких разбавлений наносят на пластинки. Пластинки, имеющие 300-1000 бляшек, снова используют для изготовления копии нитроцеллюлозного фильтра, который подвергают гибридизации с использованием обоих ДНК-зондов. Этот процесс повторяют до тех пор, пока все бляшки одной пластинки не дадут положительный сигнал гибридизации. Пример 5. Анализ полученных фаго вых клонов. а). Титрование l-фагов. Суспензии фагов разбавляют l-буфером в соотношении 1:10, смешивают и наносят на пластинки. После инкубации при 37°С определяют титр в бляшкообразующи х единицах. Для очищенных фаговы х суспензий титр составляют 2,2-8,6 х 1010 ед. мл. б). Получение l-фаговой ДНК. После выделения и титрования гомогенных фаговы х клонов их наносят плотностью 2 х 106 единиц (13,5 см чашки Петри с культуральной средой следующего состава: 1,5% агарозы, 10 г/л триптофана, 5 г/л дрожжевого экстракта, 5 г/л NaCI, 10мМ MgSO 4 и 0,2% глюкозы) вместе с 200 мкл Мg-клеток E.coli С 600 (оптическая плотность 4 при 600 нм), инкубируют в течение 5 ч при 37°С и затем охлаждают до 4°С. Элюцию фагов осуществляют переслаиванием пластинок 8 мл l-буфера и несколькими каплями хлороформа при слабом качании при 4°С в течение ночи. Очищенную центрифугированием надосадочную жидкость удаляют и фаги центрифугируют при 5000 об/мин, в течение 30 мин при комнатной температуре. После добавления 500 мкл l-буфера и инкубации с рибонуклеазой А (10 мкг/мл) и дезоксирибо-нуклеазой (1 мкг/мл) в течение 30 ми» при 37°С и концентрацию соли повышают добавлением 25 мкл 0,5 Μ ЭДТУК, 12 мкл 1 Μ трис-HCl, рН 8,0 и 6,5 мкл 20% ДСН и инкубируют при 70°С в течение 15 мин. После экстракции фенолом и двукратной экстракции смесью хлороформа и изоамилового спирта (24: 1) ДНК осаждают добавлением 0,1 объема ЗМ ацетата натрия с рН 5,2 и 2 объемов спирта, центрифугир уют, промывают. 70%-ным спиртом, сушат и растворяют в 50 мкг буфере ТЕ. в). Рестрикционный анализ. По 2 мкл раствора ДНК инкубируют с 5 ед. EcoRI в буфере X в течение 2 ч при 37°С, полученные фрагменты разделяют в 1 %-ном агарозном геле. Фрагменты длиной 500-1000 п. о. злюируют из геля и подвергают анализу. г). Анализ последовательностей. 100 нг фрагментов встраивают в соответственно приготовленную форму дзДНК (репликативная форма, 50 нг) вектора путем инкубации в течение 2-12ч при 14°Св 10 мкл раствора лигирования. Рекомбинантной конструкцией с обозначениями BS3, BS5, BS8, BS9, BS12, BS13, BSXIII трансформируют компетентные клетки E.coli (штамм IM 101). Выделяют однонитевую ДНК рекомбинантных фагов и проводят анализ последовательностей по Сангеру при использовании вычислительных программ. Выделенный клон 8 (BSS) содержит кодирующую последовательность аминокислоты 22 зрелого энзима. Пример 6, Конструкция экспрессионной кассеты. Для экспрессии человеческой MnO2-дисмутазы чМn-Д) в дрожжах используют промотор ADHI первоначальной длиной около 1500 п. о., укороченный промотор ADHI длиной около 400 п. о. и ADHII терминатор. а). Пополнение гена. Так как у выделенного клона 8 кДНК на N-конце отсутствует участок, соответствующий 21 аминокислоте, для пополнения гена конструируют и синтезируют с учетом выбора дрожжевого кодона 2 пары олигонуклеотидов (фрагмент Xhol/Xbal) согласно формуле (ОП1): ОП1 вставляют через Xho I/Xba І в плазмиду V17 (полученную из pUC18 после рестрикции Hinс II и введения линкеров Xho I (dCCTCGAGG) и рестрикции Smal полученной плазмиды pES102 с последующим выделением линкеров Nco I (dCCCATGGG), а ОП2 через Xba I/Nco I следующим образом. По 4 мкг ДНК V17 переваривают 10 ед. Xba I и Nco I или Xho I и Xba l в течение 2 ч при 37°С и очищают путем гельэлектрофореза (0,7% агарозы). По 5 мкл синтезированных нитей ОП1 и ОП2 (каждый раз 10 рМ/мкл) перемешивают, инкубируют в течении 10 мин при температуре 65°С и медленно охлаждают до комнатной температуры. По 1/10 полученного объема подвергают лигированию с 50 нг разрезанного ХНо I вектора (в случае ОП1) или разрезанного Xba I и Nco I вектора (в случае ОП2). После двойного переваривания Sсa I и Xba I в буфере Коре в течение 2 ч при 37°С, очистки и выделения разрезанных векторов путем гельэлектрофореза HSOD2 и HSOD3 подвергают лигированию (клонирование олигонуклеотидных пар ОП1 и ОП2) с получением плазмиды ΗSODY, которую гидролизуют рестриктазой Nco I, инкубируют с фрагментом Кленова и гидролизуют рестриктазой Eco RI. При этом 5 мкг ДНК инкубируют с 18 ед. Nco І в течение нескольких часов в 50 мкл буфера X при 37°С, разрезанную ДНК очищают гельэлектрофорезом и половину инкубируют с фрагментом Кленова. ДНК очищают гельэлектрофорезом, выделяют и гидролизуют 7,5 ед. Eco RI в 20 мкл буфера X, е ще раз очищают и выделяют. Плазмидой BS8, содержащей выделенный клон 8 кДНК, трансформируют компетентные клетки Е.соli (штам 1М101) и получают плазмиду. 10 мкг плазмиды переваривают с 25 единицами Tha І в 40 мкл буфера Thal в течение 8 ч при 60°С, фрагмент длиной 759 п. о. гидролизуют с помощью Eco RI с последующей очисткой гельэлектрофорезом. Фрагмент Tha I/Eco RI объединяют с плазмидой HSOD4, получая HSOO6. Плазмида HSOD6 содержит полную кДНЕ для чМn = Д, включая Met. При этом сохраняется рамка считывания. б). Конструкция экспрессионной кассеты. Плазмиду HSOD6 переваривают с Xho Ι и Eco RI в буфере Коре, выделяют фрагмент Xho I и вводят в плазмиду PKHI, соответственно РКН2 через Xho I/Eco RI. В плазмиду PES 103, содержащую промотор ADHI в качестве фрагмента Bam I/Xho I длиной 1500 п. о. в PES 102 (PES 102 представляет собой производное pUC18, которое в месте разреза Hinc II содержит линкер Xho I), вводят линкер Bg1 II после рестрикции Sma I (1 мкг плазмиды подвергают перевариванию 5 С ед. Sma I в буфере Sma І в течение 2 ч при 37°С), очистки и выделения. Полученную таким образом плазмиду превращают в плазмиду Р154/2 рестрикцией инкубацией с фрагментом Кленова и повторным лигированием. После переваривания Xho I и Hind III в буфере Коре в плазмиду pES103 вставляют синтезированный линкер - Xho I, Eco RI. Xba I, Hind III. Э тот линкер имеет следующую последовательность: TCGAGGATTCTCTAGAA CCTTAAGAGATCTTTCGA. В плазмиду р150/1 (после переваривания Xba I/Hind III в буфере Коре) вставляют терминатор ADHII, получая плазмиду 150/2. Ε Терминатор ADHII получают следующим образом. Плазмиду pMWS ADHII переваривают сначала Hind III, затем Spn I и фрагмент длиной 605 п. о. клонируют вектор V18 и в место разреза HincII вставляют линкер Xba E I (CTCTAGAG). Фрагмент Xba I/Sph I длиной 335 п. о. вводят в pUC18 (pGD2). Вектор V18 получают за счет того, что в PUC18 вводят линкер Hind III по сайту Sma I. Место мультиклокирования в V18 содержит Eco RI, Sst I, Kpn I. Hind III, Bam HI. Xba I, Salll, Pst, Sphl. После переваривания Xba I и Hind III терминатор ADHII выделяют. Таким образом, за исключением вводимого через Xho I Eco RI гена плазмида р150/2 содержит необходимые для экспрессии гена промотор длиной около 1500 п. о., линкер Xho I длиной 7 п. о. линкер Eco RI длиной 6 п. о., линкер Xba I длиной 7 п. о., терминатор длиной 329 п. о. Эти единицы вставляют через Bam Hi/Hind III в вектор р154/2. В получаемой плазмиде рКН1 заменяют промотор ADHI на укороченный промотор ADHIk из фрагмента Bam Hl/Xho I (длиной 412 п. о.) плазмиды рКН2. В обе плазмиды вставляют по сайтам Xho I/Eco RI полный ген кДНК, вырезанный из HSOD6. Получаемые плазмиды HSOD7/1 и HSOD7/2 отличаются друг от друга только различными промоторами ADHI и ADHIk. После двойного переваривания Bg lll/Hind III и выделения экспрессионных фрагментов изготовленные экспрессионные кассеты вставляют в соответственно подготовленные дрожжевые трансформационные векторы УЕр13 (АТСС37 115), plDB207(DSM3181) pEAS102 YIpS (ATCC 37062) через места разреза Bam III и Hind III. Пример 7. Получение пригодного для экспрессии дрожжевого мутанта Μn=Д. Ген дрожжевого мутанта Μn=Д содержится в качестве фрагмента Ваm НІ в векторе PL41. После рестрикции Bam HI фрагмент длиной 2045 п. о. очищают гельэлектрофорезом, выделяют и субклонируют по сайту Ваm НІ в вектор VO. Вектор VO получают за счет того, что 1 мкг pVC18 гидролизуют рестриктазой Hind III. Фрагмент выделяют из геля, выступающие концы пополняют полимеразой Кленова и лигируют Т4-ДНК лигазой. Полученную плазмиду SODY1 превращают в SOD Y3 путем гидролиза рестриктазой Nrv1 и встраиванием линкера Hind III (CAAGCTTG). В место разреза вставляют ген URA3, полученный из pURA3, SODY3 переваривают с Hind III и дефосфорилируют в следующих условия х. К 40 мкл реакционной смеси добавляют 40 мкл Н2О, 10 мкл 1мМ ЭДТУК, 5 мкл трис-НСІ, рН 9,5, 1 мкл 100мМ спермидина и 1 мкл (1 мг/мл Н2О) щелочной фосфатазы кишечника теленка (ФТК) и инкубируют при 36°С. По истечении 15 мин еще раз добавляют 1 мкл ФТК и инкубируют в течение 15 мин. Дефосфорилированный вектор очищают электрофорезом в агаровом геле. 2 мкг плазмиды pURA3 режут Hind III и фрагмент длиной 1,2 т. п. о., содержащий дрожжевой ген URA3, выделяют и вставляют в подготовленный вектор. Получаемые таким образом плазмиды SODY7 и SODY8 содержат ген URA3 в дрожжевом гене Mn-Д и различаются ориентацией гена URA относительно гена Мn-Д. Ориентацию гена URA3 относительно, гена Mn-Д можно устанавливать, так как ген URA3 содержит асимметричное место Pst I. Плазмидой SODY7 и SODY8 трансформируют штамм DBY 747 (генотип a, leu 2, his 3, trpi, ura3) следующим образом. 2 мкг SODY7 и SODY8 режут 50 ед. Ваm НI в 200 мкл буфера Ваm НІ (150мМ NaCI, 6мМ трис-НСl, рН 7,9, 6мМ МgСІ 2, 1мМ ДТT) и всю смесь (без отделения части pUC) экстрагируют фенолом и осаждают этанолом. ДНК растворяют в воде и используют для трансформации дрожжей. Трансформанты выращивают в среде SC-URA в течение ночи при 28°С. Клетки отделяют центрифугированием, разрушают и исследует на содержание в них Mn-Д. При этом для определения Мn-Д, с одной стороны, и Cu/Zn = Д, с другой стороны, работают по известным методикам с использованием гельэлектрофореза путем разделения протеинов с последующим окрашиванием нитросиним тетразолием. Повысить чувстви тельность можно путем окрашивания дианизидином. Для обеспечения дальнейшего анализа применяют спектрометрический метод с использованием щелочного диметил-сульфоксида в качестве выделяющей кислород системы и цитохрома С в качестве восстановителя. Mn-Д и Cu/Zn-Д можно различать путем добавления KCN. Штаммы SODY/72, SOD Y7/6, SOD Y7/8 и SOD Y7/10 не проявляют активности Мn-Д. Пример 8. Получение экспрессионных векторов. Из плазмид HSOD7/1 и HSOD7/2 вырезают фрагменты Bg III, Hind III. Плазмиды YEp13, pIDB и pEAS 102 также гидролизуют Hind III и Bam III. По 50 мкг векторной ДНК и 200 мкг вставки лигируют и трансформируют в штамм E.coli HB 101. В табл. 1 приведено обозначение соответствующи х плазмид. Пример 9. Получение пригодного для трансформации дрожжевого штамма (WS30-5g). Получают дрожжевой штамм, который, кроме описанных для штамма SODY/2 генетических маркеров, дополнительно содержит мутацию в одной из лизосомальных основных протеаз и, таким образом, при разрушении дрожжевых клеток выделяет меньше протеаз. Для этого дефицитный Мn-Д штамм SODY7/2 скрещивают с дефицитным по протеазам штаммом VVS20=25 (a, Ieu2, his3, trpi, uraЗ, рер4). Штамм VVS30-5g, можно трансформировать, он отвечает соответствующим требованиям. Такие скрещивания можно с успехом осуществлять с другими известными дрожжевыми штаммами, например, с 20 В-12. Пример 10. Трансформация дрожжей и экспрессия в дрожжах. Штамм SODY/2 трансформируют плазмидами pWS371A, pWS372A и pWS373A. Трансформанты исследуют на экспрессию. Трансформанты выращивают в жидкой среде SC-1leu при встряхивании. 100 мкл культуры инокулируют в 4 мл YP5%D (1% дрожжевого экстракта, 2% пептона, 5% глюкозы) и выращивают в течение ночи, клетки отделяют и расщепляют согласно примеру 7. Hа активирующий гель наносят такое количество сырой жидкости клеток, которое соответствует 1 мл культуры. Опыт по определению активности проводят по примеру 7. Дрожжевой штамм VVS30-5g (Ieu2, his3, trp1, pep4, sod1) также трансформируют плазмидами pWS550A, pWS490A, pVV491A. Измеренное в дрожжах в эти х условиях количество Mn-Д соотве тствуе т примерно 0,5 мг/л культуры. Пример 11. Синтез линкера. Изготавливают шесть различных олиго-нуклеотидов ЕВ1656, ЕВ1636, ЕВ1643, ЕВ1643, ЕВ1646, ЕВ1660 и ЕВ1638 со следующем последовательностью и длиной Олигонуклеотиды EBI636, EBI643, ЕВІ646 и ЕВІ660 фосфорилируют с 5'-концов в следующи х условия х. Исходная реакционная смесь №1 содержит 2 мкл EBI 636 (100 пмоль), 1 амкл 10х линкерного буфера киназы, 3 мкл 10мМ АТР, 1 мкл Т4, полинуклеотидкиназы (10 ед./мкл), 3 мкл воды. Исходная реакционная смесь №2 аналогична смеси №1, но с 2 мкл (100 пмоль) EBI660. Исходная реакционная смесь № 3 содержит 2 мкл олигонуклеотида EBI 643 (100 пмоль), 1 мкл 10х линкерного буфера киназы, 3 мкл 10мМ АТР, 1 мкл Т4-полинуклеотидкиназы (10 ед,)(мкл, 1 мкл воды). 10х линкерный буфер киназы состоит из 0,7 Μ трис-НСl, рН 7,6, 0,1 Μ MgCl 2, 0,05 Μ ДТТ. Реакцию осуществляют в течение 30 мин при 37°С. Затем Т4-полинуклеотидкиназу инактивируют путем нагрева до 100°С. Олигонуклеотиды EBI 656 и EBI 638, которые образуют 5'-концы готовой вставки ДНК длиной 128 п. о. не фосфорилируют, чтобы избежать образования мультимерных вставок ДНК на последующей стадии реакции лигирования. Линкер конструируют из отдельных олигонуклеотидов по схеме: К реакционной смеси №1 добавляют 2 мкл (100 пмоль) ЕВ 1656, а к реакционной смеси №2 - 2 мкл ΕΒΙ 638 (100 пмоль) и проводят реакцию гибридизации олигонуклеотидов друг с др угом. В исходной реакционной смеси №3 содержатся уже 2 комплементарных олигонуклеотида (ЕВI 643. ΕΒΙ 646). 3 смеси нагревают в течение 2 мин при 100°С и медленно охлаждают. Получаемые в реакциях №1-3 короткие двухнитевые фрагменты ДНК лигируют друг с другом следующим образом; 10 мкл смеси №1 (ΕΒΙ 636 + ЕВI 656): 10 мкл смеси №2 (ΕΒΙ 660 + ΕΒΙ 638); 10 мкл смеси №3 (ЕВІ 643 + EBI 646); 3 мкл 10мМ АТР; 1 мкл лигазы ДНК (7 ед./мкл). Реакцию осуществляют в течение 15 ч при 4°С. ДНК разделяют в 1 %-ном агарозном геле и фрагмент ДНК длиной 128 п. о. выделяют из геля путем элюции. Пример 12. Конструкция экспрессионных векторов. Плазмиду HSOD6 переваривают рестриктазами Хhо I и Хbа I и вставляют в нее линкер длиной 128 п. о. (Xho I - митохондриальный лидер - Хbа I) известным методом (рЕ022-А). Ген чМn-Д, снабженный митохондриальной дрожжевой лидерной последовательностью ДНК, подвергают двойному перевариванию Xho I и Eco RI и через Xho I - Eco Rl вставляют в рКН1 (рЕ023-А). Изготовленную таким образом зкспрессионную кассету вставляют аналогично примеру 8 через Bgl Il/Hind III в дрожжевые трансформационные векторы YEp13, plDB207 и pEAS102 no сайтам Bam III и Hind III. Пример 13. Трансформация дрожжей и экспрессия в дрожжах. Дрожжевой штамм WS30-5g (пример 9) трансформируют полученными плазмидами и трансформанты исследуют на и х экспрессию (пример 10). Штамм WS30-5g выращивают в культуре следующего состава, г/л: дрожжевой экстракт 6,7; глюкоза 10; аргинин 0,16; лизин 0,25; триптофан 0,06; метионин 0,08; цистеин 0,03; гистидин 0,10; тирозин 0,16: фенилаланин 0,17; треонин 0,16; изолейцина 0,18; валин 0,21; глутаминовая кислота 0,40; глицин 0,21; цистеин 0,02; аланин 0,15; аспарагиновая кислота 0,20; пролин 0,20; серии 0,15; аспарагин 0,10; глутамин 0,20; аденин 0,025; урацил 0,050. Процесс выращивания осуществляют при аэрации до достижения оптической плотности 0,01 при 546 нм с использованием магнитной мешалки. Основную культур у состава: 8,0 г/л (NH4)2SO 4; 2,56 г/л (ΝΗ4)2ΗΡΟ4; 1,16 г/л KCl; 0,60 г/л MgSO4×7H2O; 0,56 г/л СаСl2×Н2О; 0,04 мг/л биотина; 80 мг/л м-инозита; 40 мг/л Сапантотената; 8 мг/л тиамина; 2 мг/л пиридоксина; 3,1 мг/л CuSO4×5H2О; 19 мг/л: FeCl 3×6H2O; 12 мг/л ZnSO4×7H2O; 14 мг/л MgSO4×H2О; 5 мг/л Н3ВО3; 1 мг/л Кl; 2 мг/л Na2 MgSO4×2H2O; 1 г/л дрожжевого экстракта; 0,2 г/л урацила; 0,1 г/л аденина: 0,5 г/л лимонной кислоты; 15 г/л глутаминовой кислоты; 0,2 г/л гистидина; 0,5 г/л триптофана; 100 г/л глюкозы, получают в ферментере емкостью 20 л. В качестве инокулята используют 5% количества предварительной культуры, выращивание осуществляют аэрацией при размешивании (100 об/мин) и постоянном значении рН 5,0 при 28°С. После снижения содержания глюкозы до 50 г/л еще раз добавляют 50 г/л глюкозы и продолжают ферментацию до тех пор, пока содержание глюкозы не составит 10 г/л (примерно через 45 ч) охлаждают, центрифугир уют и биомассу замораживают. Выход биомассы 18 г/л влажных клеток. Пример 14. Получение дрожжевых митохондрий. Для того, чтобы установить приводит ли введение дрожжевой митохондриальной лидерной последовательности перед геном чМn-Д к импорту протеина в митохондрии, изготовляют дрожжевые митохондрии и определяют активность Мn-Д в митохондриях и цитоплазме. Культуру выращивают п утем встряхи вания (300 об/мин) при 28°С в течение ночи, инокулируют 225 мл среды YPD и выращивают в указанных условиях · течение ночи. После достижения оптической плотности 5-7 при 6000 нм клетки центрифугируют при 6500 οб/мин в течение 5 мин. Клетки промывают водой, суспендируют в 1 Μ маннита, 20мМ КР; (КН2РО4 /К2НРО 4), рН 7,4, добавляют 1 мг/мл цимолазы с мол. массой 500 и 2 ч встряхивают (50 об/мин) при 28°С, получая сферопласты. Их центрифугир уют при 3000 об/мин в течение 5 мин, промывают раствором 1 Μ маннита, 20мМ КР; рН 7,4, 1мМ фторида фенилметилсульфонила (ФФМС). Надосадочную жидкость удаляют и добавляют стеклянные шарики диаметром 0,1мМ в количестве, соответствующем 1-2 объема промытых клеток. Клетки разрушают, суспендируют в 2,5 мл 0,65 Μ маннита, 1мМ ЭДТУК, 1мМ ФФМС, центрифугируют при 2000об/мин в течение 5 мин. Митохондрии выделяют из надосадочной жидкости путем центрифугирования при 12000 об/мин в течение 10 мин. Надосадочная жидкость содержит цитоплазму и поэтому ее хранят с тем, чтобы потом исследовать активность Мn-Д. Красно-коричневый, центрифугат промывают буфером (белые цитоплазматические компоненты выливают) и затем митохондрии суспендируют в 2-5 мл того же буфера. Загрязнения еще раз удаляют путем центрифугирования при 4000 об/мин в течение 5 мин. Митохондрии удаляют из надосадочной жидкости путем повторного центрифугирования (при 122000 об/мин в течение 10 мин). Митохондрии разрушают при помощи стеклянных шариков и, используя активирующий гель, их исследуют на содержание Мn-Д. Пример 15. Очистка чМn-Д. Стадия 1: разрушение клеток. Клетки (пример 13} промывают в 10 мл дистиллированной воды на 1 г влажной массы и центрифугируют при 16000 об/мин в течение 15 мин. Осадок повторно суспендируют в натриево-калиевом фосфатном буфере (50 мМ, рН 7,0) при соотношении 1:3. Затем клетки разрушают в мельнице при помощи стеклянных шариков диаметром 0,1мМ при расходе 6 л/ч. Экстракт клеток центрифугируют в течение 15 мин (16000 об/мин 4°С) и осадок удаляют. Стадия 2: осаждение полиэтиленимином. К надосадочной жидкости первой стадии добавляют 5%-ный водный раствор полиэтиленимина (рН 8,0) конечной концентрации 0,5%. Затем продолжают размешивать еще в течение 30 мин и осадок удаляют центрифугированием при 16000 об/мин в течение 30 мин. Стадия 3: осаждение путем термообработки. Надосадочную жидкость второй стадии при перемешивании нагревают до 60°С в водяной бане с температурой 80°С, находящейся в стальных стаканах. Затем в ледяной бане охлаждают до комнатной температуры. Выпавший протеин удаляют центрифугированием (10000 об/мин в течение 10 мин при 4°С). Стадия 4: осаждение сульфатом аммония. Надосадочную жидкость стадии 3 насыщают сульфатом аммония до 20% и осадок отделяют центрифугированием (10000 об/мин в течение 15 мин при 4°С). Затем концентрацию сульфата аммония повышают до 90% и осадок отделяют центрифугированием (10000 об/мин в течение 15 мин при 4°С). Осадок поглощают в незначительном количестве (50 мМ, рН 6,0) буфера морфолиноэтансульфоната - 2морфолиноэтансульфоновой кислоты (буфер МЭС) и диализуют в течение ночи с использованием того же буфера. Стадия 5: хроматография на катионите. Колонку, содержащую катионит моно-S-HR 5/5 уравновешивают 5 объемами буфера МЭС. После подачи экстракта на колонку не связанные протеины промывают 5 объемами буфера МЭС. Затем чМn-Д элюируют 20 объемами буфера МЭС с линейным градиентом от 0 до 50мМ NaCI. Фракции, содержащие активность MnД, объединяют и диализуют с использованием натриево-калиевого фосфатного буфера (5 мМ, рН 7,0). Стадия 6: хроматография на гидроксилапатите. На уравновешенную фосфатным буфером (5 мМ, рН 7,0) колонку гидроксилапатита подают диализат стадии 5 и чМn-Д элюируют 20 объемами натриево-калиевого фосфатного буфера с рН 7,0 с линейным градиентом от 5 до 300мМ указанных солей. За степенью очистки чМn-Д наблюдают при помощи электрофореза в полиакриламидном геле с использованием ДСН. В результате очистки получают 21 мг (1,16 мг/клетки) чMnO2-дисмутазы. Пример 16. Характеристика чМn-Д. Очищенную чМn-Д анализируют при помощи жидкостной гельхроматографии под давлением, жидкостной хроматографии с обратной фазой под давлением, гельэлектрофореза с использованием ДСН, нативного гельэлектрофореза и изоэлектрического фокусирования и сравнивают с естественной чМn-Д. а). Жидкостная гельхроматография под давлением. Колонка; Уотерс Протеин Пак I 125,2 х (7,8 x 300 мМ), диаметр частиц геля 10 мкм; элюент: 0,5 Μ Na2SO4, 0,02 Μ Na2SO 4, рН 7,0, 0,04% Твин 20, 25% пропиленгликоля; скорость подачи 0,5 мл/мин; детекция: поглощение УФ, 214 нм. Естественная и получаемая предлагаемым способом чМn-Д показывает главный пик тетрамера энзима при мол. массе 70000 и 76000соответственно, причем градуирование осуществляют с использованием четырех стандартных протеинов. б). Жидкостная хроматография с обратной фазой под давлением. Колонка; Бакербонд ВП С 18, 4,6 x 250 мМ, 5 мкм диаметра частиц, диаметр пор: 30 нм; элюент A: 0,1 %ная трифторуксусная кислота в воде; элюент Б: 0,1 %-ная трифторуксусная кислота в ацетонитриле; градиент; 20% Б в течение 2 мин, 20-68% Б в течение 24 мин, 68% Б в течение 10 мин. 68 - 20% Б в течение 1 мин; скорость подачи 1,0 мл/мин; детекция: поглощение УФ, 214 нм и 280 нм. Естественная и получаемая предлагаемым способом чМn-ДП проявляют время удерживания около 21 мин (20,7 и 20,9 мин, соответственно). в). Гельэлектрофорез с использованием ДСН. Разделительный гель - 15% акриламида; стекинг-гель - 4% акриламида; окраска серебром; величина геля 0,75мм (8x10 см); режим: 60 мин, 150 В. При подготовке проб для чМn-Д пробы смешивают с ДТТ в качестве восстановителя и кипятят. В геле ДСН обнаруживается мономер чМn-Д с мол. массой около 25000. В зависимости от степени полноты реакции восстановления можно доказать также наличие тетрамера с мол. массой около 90000. г). Нативный гельэлектрофорез. Разделительный гель - 7,5% полиакриламидный гель; стекинг-гель - 2% акриламида + сахароза; величина геля 0,75мм (8x10 см); режим: 75 мин, 150 В; окрашивание кумасси голубым. Получаемая после хроматографии на гидроксилапатите чМn-Д проявляет после электрофореза как после окрашивания кумассисиним (нанесенное количество чМn-Д 0,3 мкг), так и после активирующего окрашивания о-дианизидином единую и находящуюся в том же положении полосу. д). Изоэлектрическое фокусирование, Пределы значения рН 3,5-9,5; гелевые пластинки LKB (1мм x (9 x 10 см); электродные растворы; 1 Μ фосфорная кислота анод), 1 Μ натриевый щелок (катод); температура охлаждения 7°С; объем проб 4,0 и 6,5 мкг соответственно; режим: предварительное фокусирование 500 Вч: фокусирование 3000 Вч в целом; окраска: кумасси-голубой, о-дианизидин. В качестве изоэлектрической точки определяют рl = 8,15. Пример 17. Конструкция кДНК-гено-банка из печеночной ткани человека. Аналогично примеру 1 из свежей печеночной ткани (приблизительно 1 кг) выделяют РНК, получают поли(А)+ РНК и синтезируют кДНК. Получение lgt10-гено-банка осуществляют аналогично примеру 1. Пример 18. Использование гена MnO2-дисмутазы в качестве ДНК-зонда. Полная кДНК гена МnО2-дисмутазы (пример 6) используется в качестве радиоактивно маркированного ДНК-зонда. 5 мг плазмидной ДНК HSOD6 гидролизуют рестриктазами EcoRI и Xho I. После разделяют в 1%ном агарозном геле из геля выделяют ДНК-фрагмент с длиной 600 п. о., содержащий ген MnO2-дисмутазы, его радиоактивно метят и используют в качестве ДНК-зонда. Реакционная смесь: 5 мкл 10 х НИК трансляционного буфера; 10 мкл ДНК-фрагмента; 15 мкл a=p32 dCTP/3000 С (мМоль, водный раствор); 1 мкл 1мМ dATP; 1 мкл ТТР; 1 мкл 1 мM dCTP; 5 ед ДНК полимеразы 1: вода до 50 мкл. 10 х НИК трансляционный буфер содержит 0,5 Μ трис-НСІ, рН 7,2; 0,1 м MgSO4; 1мМ дитиотреитола; 500 мкг/мл альбумина из сыворотки крупного рогатого скота. Реакцию ведут в течение 1 ч при 14°С и прекращают добавлением 5 мкл 250мМ ЭДТУК. Несвязанную радиоактивность удаляют на колонке с биогелем P6-DG. В качестве элюента используют буфер ТЕ. Гибридизацию осуществляют согласно примеру 3. Пример 19. Включение митохондриальной человеческой лидерной ДНК-последовательности MnO2дисмутазы перед геном MnO2-дисмутазы. Совместной гибридизацией двух синтезированных олигонуклеотидов (ЕВІ 917, EBI 919) получают ДНКфрагмент длиной 122 п. о. с Xho I/Xba I выступающими концами. Этот фрагмент соответствует приведенной в примере 6 формуле ОП1, с той разницей, что между стартовым кодоном ATG и кодоном для лизина AAG включают человеческую лидерную ДНК-последовательность. ДНК-последовательность, содержащая вставку с человеческим геном MnO2-дисмутазы, имеет следующую стр уктур у. Плазмиду HSOD6 гидролизуют рестриктазами Xho I и Хbа I и вставляют линкер с длимой 122 п. о. (Xho I человеческий митохондриальный лидер - Хbа I). Получают плазмиду рКН22-А, переваривают ее рестриктазами Xho I и Eco RI (по 5 ед. мкг ДНК) и вставляют в рКН 1. Получают плазмиду рКН23-А. Полученную таким образом экспрессионную кассету аналогично примеру 12 по сайтам Bglll/Hind III (после двойного переваривания плазмид и выделения экспрессионной кассеты) вставляют векторы ΥΕp13, рIDВ207 и pEAS102 по сайтам Bam HI и Hind III. В табл. 2 указаны соответствующие плазмиды. Дрожжевой штамм WS30-5g аналогично примеру 10 трансформируют экспрессионной плазмидой рКН 24АВ. Экспрессию плазмиды рКН24-АВ в штамме WS30-5g подтверждают, используя методику примера 13. Для подтверждения того, приводит ли введение дрожжевой митохондриальной лидерной последовательности перед геном MnO2-дисмутазы к тому, что протеин вводится в митохондрии, получают дрожжевые митохондрии согласно примеру 14 и анализируют активность MnO2-дисмутазы в митохондриях, а также в цитоплазме. Пример 20. Конструкция экспрессионной кассеты с промотором ADHII (спиртовой дегидрогеназы II). В экспрессионной кассете рКН1 (пример 66) промотор ADHI заменяют промотором ADHI по сайтам Xho I/Bam HI. Промотор ADHII выделяют из плазмиды pMW 5 - ADH II/B/X. Плазмида pMW 5-ADHII В/Х содержит фрагмент Bam HI/Hind III, содержащий промотор ADHII и имеющий участок гена ADHII 760 п. о. EcoRI-сайт рестрикции в начале кодирующего участка с помощью линкера превращают в Xho І-сайт рестрикции, причем получают два Ват Hl-сайта, расположенные с обеих сторон Xho I-сайта, Sph I - Xho 1-фрагмент, содержащий стыковое место между промотором и геном заменяют олигонуклеотидными парами для того, чтобы удалить кодирующий участок гена ADHII и вставить правильный переход к гену MnO2-дисмутазы. Конструируют 3 различные олигонуклеотидные пары OL1, OL2 и OL3 аналогично примеру 11 или 36, которые незначительно отличаются длиной нуклеотидной последовательности промо горной части. Согласно примеру 11 осуществляют реакции гибридизации комплементарных олигонуклеотидов: №1 EBI 1161/EBI 1164 №2 ЕВI 1167/ЕBI 1160 №3 ЕВI 1159/ЕВI 1168 №4 ΕΒΙ 1165/EBI 1166 Синтезы EBI 1164, EBI 1167, EBI 1159, EBI 1165 и лигирование олигонуклеотидов №1 + №2 = OL1 №1 + №3 = OL2 №1 + №4 = OL3 с тем, чтобы получить три олигонуклеотидные пары OL1, OL2 и OL3 со следующими ДΗКпоследовательностями: Олигонуклеотидная пара №1(OL1) из EBI 1161/EBI 1164 + EBI 1167/EBI 1160 ADHII - промоторную часть выделяют путем последовательного гидролиза рестриктазами переваривания Xho I и Bam HI и вместо ADHI-промотора вводят в экспрессионную кассету рКН1. В результате использования трех различных олигонуклеотидных лар получают три различные экспрессионные кассеты: pKH1-ADHII-OL1 PKH1-ADHII-OL2 рКН2 - ADHII-OL3 Ген MnO2-дисмутазы выделяют из плазмиды рЕ022-А (пример 12) в виде Xho I - Есо Rl-фрагмента и лигируют во все три ADHII-экспрессионные кассеты. Снабженные геном MnO2-дисмутазы экспрессионные кассеты вырезают с помощью ВgIII и Hind III и через сайты рестрикции Bam HI и Hind III лигированием вводят в дрожжевые векторы рID207 и YEp13 аналогично примеру 8. Дрожжевые экспрессионные плазмиды с промотором ADHII приведены в табл. 3. Дрожжевой штамм WS30-5g трансформируют экспрессионными плазмидами, указанными в табл. 3, и продукты трансформации аналогично примеру 13 исследует на экспрессию. Пример 21. Конструкция экспрессной ной кассеты с промотором тионеина/меди (CUP1). Промотор CUP1 аналогично примеру 20 путем замены ADHII-промотора встраивают в рКН1 по сайтам рестрикции Bam HI и Xho I. Дрожжевой промотор CUP1 лигируют с 8 олигонуклеотидами, синтезированными аналогично примеру 36 или 11. Для достижения желаемого сочетания CUP1-промотора с отдельными 1691/1692/1696/1704/1711/ /1710/1716 по схеме: олигонуклеотидами EBI осуществляют: 1} синтез олигонуклеотидов EBI 1692, ЕВI 1704, ЕВI 1710, EBI 1716 2} реакции гибридизации олигонуклеотидов №1 EBI 1691/EBI 1692 №2 EBI 1696/EBI 1704 №3 EBI 1711/EBI 1710 №4 EBI 1716/EBt 1717 3) лигирование олигонуклеотидов с олигонуклеотидами №1 и 2, согласно примеру 11; ДНК-фрагмент элюируют из 2 %-ного агарозного геля и по сайтам Bam HI - Xba I вводят в pES 102 (пример 6а). Подучают плазмиду рЕ046. Олигонуклеотиды №3 и 4 лигируют др уг с др угом, ДНК-фрагмент элюируют из 2%-ного агарозного геля и вводят по сайтам Xba I - Xho і в рЕ046. Получают плазмиду рЕ047. Теперь весь CUP1-промотор можно лигировать в pKH1 no сайтам Bam H1 и Xho I. Получаемую экспрессионную касету называют рЕ048. Ген MnO2-Дисмутазы выделяют из плазмиды рЕ022-А (пример 12) с помощью рестрикции энзимами Xho I и Eco RI и лигируют в экспрессионную кассету в Ε 048. Снабженную геном MnO2-дисмутазы экспрессионную кассету гидролизуют рестриктазой ВgIII и аналогично примеру 8 по сайтам Bam HI и Hind III вводят в дрожжевые векторы рIDВ207 и уЕр13. Дрожжевые экспрессионные плазмиды с CUΡ1-промотором приведены в табл. 4. Дрожжевой штамм WS30-5g трансформируют аналогично примеру 13 экспрессионными плазмидами, указанными в табл. 4, и продукты трансформации исследуют на экспрессию. Пример 22. Экспрессия MnO2-дисмутазы в эукариотических клетках животного происхождения. а). Конструкция экспрессионных плазмид. Ген MnO2-дисмутазы с помощью синтетических олигонуклеотидов снабжают на конце 5' соответствующими контрольными и лидерными последовательностями. Необходимыми контрольными последовательностями являются сайт САР и стартовый сигнал ATG. Для секреции в среде используют лидерную последовательность омега-интерферона (ω-ИФ). Для внутриклеточной продукции используют человеческую митохондриальную лидерную последовательность MnO2-дисмутазы. Путем сочетания четырех синтетических олигонуклеотидов OL39, OL40, OL41, OL42, получаемых согласно примеру 36 или 11: получают фрагмент ДНК длиной 192 п. о. с выступающими концами Hind III/Xba I. Этот фрагмент ДНК представляет собой 5'-нетранслируемый участок ω -ИФ с сайтом САР, стартовым сигналом ATG, ω-ИФ-лидерной последовательностью (21 аминокислота) и кодирующий участок первых тринадцати аминокислот MnO2-дисмутазы (от лизина до аланина). Путем сочетания синтетических олигонуклеотидов OL39, OL40 указанных формул и синтетических олигонуклеотидов OL43 и OL44 получают ДНК-фрагмент длиной 196 п. о. С выступающими концами Hind Ill/Xba I. Этот ДНК-фрагмент представляет собой часть нетранслированного 5'-участка ω-ИФ с сайтом САР и стартовым сигналом ATG, а также с митохондриальной лидерной последовательностью MnO2-дисмутазы человека (24 аминокислоты) для внутриклеточной продукции MnO2-дисмутазы и кодирующего участка первых тринадцати аминокислот MnO2-дисмутазы. Олигонуклеотиды OL39, OL42 и OL44 фосфорилируют на 5'-конце при помощи Т4-полинуклеотидной киназы с тем, чтобы обеспечить осуществление последующей реакции лигирования. Реакционная смесь: 2 мкл олигонуклеотида (100 пмоль); 1 мкл 10 х буфер линкерной киназы; 3 мкл 10мМ АТР; 1 мкл Т4-полинуклеотидной киназы, 10 ед/мкл. 10 х буфера линкерной каназы содержит 0,7 Μ трис-НСІ, рН 7,6; 0,1 Μ MgCl2; 0,05 Μ дитиотреитола. Реакцию ведут 30 мин при 37°С, энзим инактивируют путем нагревания до 100°С. Олигонуклеотиды OL40, OL41 и OL43, образующие 5'-концы готовых ДНК-фрагментов, не фосфорилируют во избежание образования мультимерных ДНК-вставок при последующей реакции лигирования. Гибридизацию комплементарных олиго-нуклеотидов друг с другом осуществляют следующим образом: Олигонуклеотиды А и Б представляют собой комплементарные олигонуклеотиды. Реагенты: №1: А = OL39 Б = OL40 №2: A = OL41 Б = OL42 №3: А = OL43 Б = OL44 Реакционная смесь: 1 мкл олигонуклеотида A (100 пмоль); 1 мкл олигонуклеотида Б (100 пмоль); 8 мкл воды. Реакционные смеси №1-3 нагревают при 100°С в течение 2 мин и медленно охлаждают в водяной бане до комнатной температуры. Получаемые результаты реакций 1-3-κοроткие двунитевые фрагменты ДНК лигируют друг с другом следующим образом: Лидер ω-ИФ: 5 мкл реакционной смеси №1; 5 мкл реакционной смеси №2; 1,5 мкл/мл 10мМ АТР; 0,5 мкл/мл ДНК-лигазы (7 ед/мкл). Мито хондриальная лидерная последовательность MnO2-дисмутазы: 5 мкл реакционной смеси №1; 5 мкл реакционной смеси №3; 1,5 мкл 10мМ АТР; 0,5 мкл ДНК-лигазы (7ед.). Реакции протекают в. течение 15 ч при температуре 4°С. ДНК разделяют по размерам на 2%-ном агарозном геле и желаемые ДНК-фрагменты длиной 192 и 196 п. о. элюируют из геля. Готовый ДНК-фрагмент длиной 192 п. о. с лидером ω-ИФ для секреции MnO2-дисмутазы в среду лигируют в HSOD6 по сайтам Hind III и Хbа I. Получают плазмиду HSOD11. Плазмиду гидролизуют по сайтам Eco RI и обрабатывают фрагментом Кленова с образованием тупых концов. Затем переваривают Hind III и большой ДНК-фрагмент длиной приблизительно 700 п. о. выделяют из 1.5%-ного агарозного геля. ДНК-фрагмент лигируют в эукариотический вектор pSV2 gptdhfr, который получают из pBR 322 dhfr разрезанием Esp I и Hind III, заполнением фрагментом Кленова и лигированием в вектор pSV2gpt по сайтам Eco RI - Bam HI, заполненным фрагментом Кленова и обработанным щелочной фосфатазой. Лигирование выделившегося большого ДНК-фрагмента, имеющего приблизительно 700 п. о. в вектор pSV2gptdhfr осуществляют после предварительного гидролиза вектора с помощью Ара I, заполнения сайта рестрикции фрагментом Кленова и дополнительного гидролиза с помощью Hind III. Таким образом, ген gpt заменяют в векторе на ген MnO2-дисмутазы. Смесь лигирования используют для трансформации E.coli HB101. После рестрикционного анализа плазмидной ДНК положительных клонов получают экспрессионную плазмиду, которую обозначают как pSV2dhfrSODf. Аналогично ДНК-фрагмент с митохондриальным лидером MnO2-дисмутазы длиной 196 п. о. по сайтам Hind III - Xbal лигируют в HSO16. Получают плазмиду HSOD12. Ген с регулярными последовательностями клонируют в эукариотический вектор pSV2gptdhfr по сайтам рестрикции Hind lll - Eco RI после предварительного заполнения выступающих концов Eco RI энзимом Кленова. Получаемую экспрессионную плазмиду обозначают как pSV2dhfrSOD2. Экспрессию pSV2dhfrS0D1 и pSV2dhfrSOD2 осуществляют в клетках СНО с де фицитом дегидрофолатредуктазы, которые культивируют в a-МЕМ-среде (10% эмбриональной телячьей сыворотки, гипоксантин, тимидин). Трансфекцию клеток СНО экспрессионными плазмидами pSV2dhfrS0D1 /D2 осуществляют известным образом. За день до трансфекции 7 х 10 клеток подают на питательные пластинки. Клетки обрабатывают продуктом осаждения фосфатом кальция, содержащим до 10 мкг плазмидной ДНК, при 37°С в течение 4 ч. Затем среду отсасывают и заменяют селекционной средой a-MEM, содержащей 10% эмбриональной телячьей сыворотки, которую каждые два дня заменяют. Колонии трансформированных клеток появляются по истечении 12-16 дней. Надосадочную жидкость (среду) исследуют на наличие активности MnO2-дисмутазы. Пример 23. Очистка MnO 2-дисмутазы. а) Разрешение клеток. Аналогично примеру 15 клеточную массу промывают дистиллированной водой и в концентрации 30% суспендируют в 50мМ трис-уксусной, кислоты, рН 8,5. Клетки разрушают в мельнице, содержащей стеклянные шарики диаметром 0,45-0,5 мМ. Экстракт клеток центрифугируют (16000 об/мин, 15 мин, 4°С и осадок удаляют). б) Осаждение нагреванием и кислотой. Надосадочную жидкость со стадии "а" нагревают до 60°С, в ледяной бане охлаждают до 20°С, добавлением 1 Μ уксусной кислоты рН среды устанавливают до 5,5, Центрифугир уют при 16000 об /мин и подвергают диализу с помощью трис-уксусной кислоты (60 мМ, рН 5,5). в) Катмонообменная хроматография. Содержащий MnO2-дисмутазу диализат со стадии "б" подают на колонку с СМ-сефарозой, уравновешенную 60мМ трис-уксусной кислотой, рН 5,5, элюируют линейным градиентом (15 объемов колонки) от 60мМ трис-уксусной кислоты до 0,12 Μ ацетата натрия. г) Гельпроникающая хроматография. Фракции с активностью MnO2-дисмутазы со стадии "в" собирают и подают на колонку, содержащую сефакрил S 300 HR или суперозу 12, уравновешенную 0,1 Μ фосфатным буфером, рН = 7, 8. Элюцию проводят тем же буфером. Получают 20 мг (1,1 мг/г клетки) чMnO 2-дисмутазы.
ДивитисяДодаткова інформація
Назва патенту англійськоюMethod for human mno2-dismutase obtaining
Назва патенту російськоюСпособ получения человеческой mno2-дисмутазы
МПК / Мітки
МПК: C12N 15/62, C12N 15/53, C12N 9/02
Мітки: одержання, мnо2-дисмутази, спосіб, людської
Код посилання
<a href="https://ua.patents.su/15-19318-sposib-oderzhannya-lyudsko-mno2-dismutazi.html" target="_blank" rel="follow" title="База патентів України">Спосіб одержання людської мnо2-дисмутази</a>
Попередній патент: Спосіб одержання кристалічного моногідратної форми 1-карбацефалоспорину
Наступний патент: Виїмково-доставна машина
Випадковий патент: Вбудовувана персональна сонячна електростанція