Спосіб виявлення взаємодії генів за кількісними ознаками

Спосіб виявлення взаємодії генів за кількісними ознаками шляхом знаходження епістатичного aabb A aabb AABB d aabb AABB da db aabb AABB aaBB AABB AAbb AABB aabb aaBB AAbb AABB iab AABB aabb aaBB AAbb . За цією формулою iab обчислюється в один прийом, що спрощує роботу. Крім того, статистична помилка siab при обчисленні iab за цією форму (19) iab UA iab : 3 51264 4 лою менша, ніж при описаному вище чотирьохсту зняється від очікуваного при адитивній дії генів, пінчастому шляху знаходження iab , а це важливо для доказу наявності епістазу. Права частина рівняння є алгебраїчною сумою оцінених із статистичними помилками середніх арифметичних. З теорії помилок відомо, що помилка алгебраїчної суми дорівнює квадратному кореню із суми квадратів помилок складових. В нашому випадку: параметр iab не значущий, взаємодією генів можна нехтувати. Всі випадки значущих відхилень від адитивності, що розуміються як взаємодія генів, можна підрозділити на дві групи: 1) позитивний епістаз s2 AABB siab 2 saabb 2 saaBB , s2 AAbb де siab - помилка епістатичного відхилення, 2 2 , saabb , saaBB , s2 - помилки відповіs2 AAbb AABB дних середніх фенотипічних значень. Взаємодія генів може бути доведена шляхом оцінки достовірності епістатичного відхилення, параметра iab . Адекватним критерієм значущості епістатичного відхилення в нашому випадку є спрощений tкритерій [Мазер К., Джинкс Д. Биометрическая генетика. Пер. с англ. - М.: Мир, 1985. - 486 с.] t iab / siab . Якщо t 2 , то параметр iab вважається значущим, адитивна модель вважається неадекватною, а взаємодія генів - доведеною. Якщо t 2 , (плюс-епістаз), коли параметр iab із знаком «+», 2) негативний епістаз(мінус-епістаз), коли iab із знаком «-». Відношення iab до AABB є параметром, який оцінює відносну силу (ступінь) епістазу I iab / AABB . При адитивній дії генів I 0 , оскі ab льки i рівно 0. При позитивному епістазі 0 I , при негативному I 0 . Відносну силу епістазу можна використовувати при порівнянні взаємодій генів за різними ознаками. Розроблений нами спосіб має свою область застосування: 1) він призначений для вивчення сумісної дії двох генів; 2) для його застосування необхідні дані про всі чотири можливі при диалельній схемі спадкоємства гомозиготні генотипи. Приклади конкретного виконання №1-3 В експерименті отримані приведені в таблиці значення середніх і їх помилок, необхідні для оцінки епістазу. спостережуване значення aabb значущо не відріТаблиця Фенотипічні значення кількісних ознак і їх помилки у вихідної,мономутантних і димутантної ліній арабідопсису Генотипи ліний ААВВ ааВВ ААbb ааbb Висота стебла 20.83±0.91 14.96±0.87 10.38±0.79 11.48±0.69 Кількість листя в розетці 6.51±0.27 8.80±0.32 5.05±0.19 5.82±0.20 Приклад № 1. За ab 6.97 1.64 , t 4.2 . За висотою стебла i Оскільки t 2 , позитивний епістаз визнається доведеним. Оцінка відносної сили епістазу I=6.97/20.83=0.34 (34 %). Приклад № 2. За ознакою «кількість листя в розетці» iab 1.52 0.50 , t 3.0 . Оскільки t ab 2 , а зна чення i негативне, має місце достовірний негативний епістаз. Оцінка відносної сили епістазу І=1.52/6.52=-0.23 (23 %). Приклад № 3. Комп’ютерна верстка Г. Паяльніков ознакою Кількість листя на стеблі 2.92±0.12 3.53±0.16 2.20±0.08 2.52±0.09 «кількість листя на ab стеблі» i 0.29 0.23 , t 1.3 . Оскільки t 2 , приймається адитивна модель; епістаз не значущий, ним можна нехтувати. Отже, запропонований спосіб виявлення взаємодії генів за кількісними ознаками відрізняється тим, що одночасно з епістатичним відхиленням визначається також статистична помилка епістатичного відхилення, яка дозволяє встановити достовірність епістазу за спрощеним t-критерієм. Підписне Тираж 26 прим. Міністерство освіти і науки України Державний департамент інтелектуальної власності, вул. Урицького, 45, м. Київ, МСП, 03680, Україна ДП “Український інститут промислової власності”, вул. Глазунова, 1, м. Київ – 42, 01601