Чутливі до сульфонілсечовини репресорні білки

Реферат: Винахід належить до способу регулювання експресії шляхом використання чутливих до сульфонілсечовини репресорних білків. UA 105017 C2 (12) UA 105017 C2 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 Галузь, до якої відноситься винахід Винахід відноситься до галузі молекулярної біології, зокрема, до регуляції експресії генів. Передумови створення винаходу Тетрациклінова система оперона, що включає елементи репресора та оператора, була спочатку виділена з бактерій. Система оперона суворо контролюється присутністю тетрацикліну та саморегулюється рівнем експресії tetA та tetR генів. Продукт tetA видаляє тетрациклін з клітини. Продукт tetR являє собою репресорний білок, що зв‘язується з елементами оператора, який має значення Kd, що становить приблизно 10 пM при відсутності тетрацикліну, блокуючи, таким чином, експресію tetA та tetR. Ця система була модифікована для контролю експресії інших полінуклеотидів, що представляють інтерес, та/або для застосування в інших організмах, головним чином, для застосування у тваринних системах. Системи на основі Tet оперона обмежуються застосуванням у рослинах, принаймні частково завдяки проблемам з індукторами, які типово являють собою антибіотичні сполуки та є чутливими до світла. Існує необхідність у забезпеченні регуляції експресії послідовностей, що представляють інтерес, в організмах, композиціях, та способах, які суворо регулюють експресію у відповідь на сполуки сульфонілсечовини. Короткий опис суті винаходу Забезпечуються композиції та способи, що відносяться до застосування чутливих до сульфонісечовини репресорів. Композиції включають поліпептиди, які специфічно зв‘язуються з оператором, де специфічне зв‘язування регулюється сполукою сульфонілсечовини. Композиції також включають полінуклеотиди, що кодують поліпептиди, а також конструкції, вектори, прокаріотичні та еукаріотичні клітини та еукаріотичні організми, включаючи рослини та насіння, що включає полінуклеотид та/або одержане за допомогою цих способів. Також забезпечуються способи для застосування чутливого до сульфонісечовини репресора до клітини або організму та для регуляції експресії полінуклеотиду, що представляє інтерес, у клітині або організмі, включаючи рослину або рослинну клітину. Короткий опис малюнків Фігура 1. Сполучення тетрацикліну-Mg++ та сполуки сульфонілсечовини Хармоні® (тифенсульфурон-метил; Ts) у зв‘язувальній кишені класу D TetR на основі кристалічної структури 1DU7 з білкової бази даних (PDB). Фігура 2. Карта типового tetR експресійного вектора на основі E. coli, pVER7314. Кістяк реплікона базується на такому pBR322. TetR домен зв‘язування ліганду (LBD) фланкується сайтами SacI та AscI. KMsp172 та KMsp173 представляють собой сайти зв‘язування для праймерів, що використовуються для секвенування ДНК вбудованих tetR генів. rrnB T1 T2 являє собою сильний термінатор транскрипції для інгібування невпорядкованої транксрипції та хаотичної експресії. tetR Фігура 3. Відповідь бібліотеки 1 хітів на 20 мкг/мл тифенсульфурон-метилу (Ts). KM3 клітини E. coli, що несуть путативні tetR хіти L1-1 - L1-20 або tetR дикого типу, висаджували репліками o на M9 аналітичне середовище +/- 20 мкг/мл Ts, а потім інкубували при 30 C до тих пір, поки не була очевидною відмінність між білими/блакитними колоніями. У цей час колонії одержували зображення колоній та визначали відповідну -галактозидазну активність на основі ступеня забарвлення блакитних колоній. Фігура 4. Відповідні -галактозидазні активності 45 хітів путативної бібліотеки L4 проти 0, 0,2 та 1,0 частин на млн. етаметсульфурону (Es). Індуковану активність вимірювали при використанні 5 мкл перфорованої цільної клітинної суміші, а фонову активність вимірювали при використанні 25 мкл перфорованої клітинної суміші, так, що здатна до визначення активність може бути виміряна у тій самій часовій рамці для усіх обробок. Значення фонової активності множили на 10 для того, щоб привести їх в інтервал показань графіка. Права сторона графіка містить контролі TetR дикого типу та перше коло хітів L1-9. Фігура 5. Індукція -галактозидази у L7 хітах етаметсульфурону. Верхню частину хітів з L7 бібліотеки повторно впорядковували та піддавали аналізу у форматі культури у планшеті на 96 комірок для відповідної індукції за допомогою 0,02 мкг/мл та 0,2 мкг/мл індуктора (Es), та для визначення фонової активності за відсутності індуктора. Індуковану активність аналізували при використанні 5 мкл перфорованої клітинної суміші, у той час як 25 мкл клітин використовували для визначення фонової активності. Це дозволяло вимірювати усі здатні до визначення активності у тій самій часовій рамці для усіх обробок. Значення фонової активності множили на десять для того, щоб привести їх в інтервал показань графіка. Остання частина графіка показує контролі: другий цикл одержання хітів L4-89 та L4-120 та TetR(B) дикого типу з використанням етаметсульфурону; та TetR дикого типу з використанням 0, 4 мкМ atc як спорідненого індуктора 1 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 для порівняння (діагонально посмугована панель). Комірка ID, що позначена текстом з нахилом, відноситься до такого аналізу повторного впорядкування, у той час як ID вихідного клону позначені нижче за допомогою горизонтального тексту . Фігура 6. Залежний від дози ефект етамсульфурону для двох варіантів EsR, що встановлений за допомогою тимчасової експресії у листях Nicotiana benthamiana. Чорні панелі представляють TetR дикого типу, сірі панелі представляють EsR хіти A11, а білі панелі представляють EsR хіти D01. Посмугована панель представляє контроль без репресора, який показує максимальний рівень експресії репортера в аналізі. Фігура 7. Зв‘язування ДНК з tetOp за відсутності або у разі присутності ліганда. П‘ять пікомолів TetO або контрольну ДНК змішували із вказаними кількостями репресорного білка та індуктора у комплексному буфері, що містить 20 мM Tрис-HCl (pH8,0) та 10 мM ЕДТА. Фігура 8. Структури типових зареєстрованих сполук сульфонілсечовини. Фігура 9. Підсумовування різноманітності джерел, моделі бібліотеки та різноманітності хітів, а також переважання популяції для декількох поколінь бібліотек перестановки репресора сульфонілсечовини. Лінія (“-“) показує відсутність амінокислотної різноманітності, введеної у цьому положенні у цій бібліотеці. X показує, що олігомери (оліго) є призначеними для введення повної амінокислотної різноманітності (будь-якої з 20 амінокислот) у цьому положенні у цій бібліотеці. Залишки, виділені жирним шрифтом, вказують на переважання під час селекції - ті, що мають більший розмір шрифту, характеризуються більшим ступенем переважання у відібраній популяції. Залишки у дужках показують вибрані мутації. Пул філогенетичної різноманітності має походження від великої родини 34 послідовностей тетрациклінового репресора. Фігура 10. Пригнічення сульфонілсечовиною флуоресцентного репортера у калусах кукурудзи (A) або у рослинах кукурудзи (B). Фігура 11. Індукція -галактозидази у типових L13 хітах з використанням етаметсульфурону. Детальний опис Засоби для хімічної регуляції експресії були продемонстровані як цінні для вивчення функції та регуляції генів в багатьох біологічних системах. Ці системи дозволяють аналізувати вплив на експресію будь-якого гена, що представляє інтерес, у системі культури клітин цілого організму, коли трансген не може специфічно регулюватися або постійно експресуватися з причини негативних наслідків. Ці системи суттєво забезпечують можливість здійснення аналізу “імпульсної” або “пульс-чейз” генної експресії. Опосередкована хімічним перемиканням експресійна система дозволяє аналізувати геномні, протеомічні, та/або метаболомні впливи безпосередньо після активації цільового гену. Ці типи аналізів не можуть бути проведені при використанні конститутивних, пов‘язаних із розвитком, або специфічних для тканин експресійних систем. Методики хімічного перемикання можуть також забезпечувати засоби для генної терапії. Системи хімічного перемикання можуть використовуватися комерційно, наприклад, у сільськогосподарській біотехнології. Для сільськогосподарських цілей є бажаною здатність до контролю експресії та/або генетичного потоку трансгенів у навколишньому середовищі, таких, як гени стійкості до гербіцидів, зокрема, у випадках, коли існують споріднені види бур‘янів цільової культури. Крім того, наявність родини конкурентоздатних механізмів хімічного перемикання буде дозволяти проводити управління новими характеристиками з одного трансгенного матеріалу, наприклад, одна продукційна лінія може використовуватися для передачі вибраних ознак за вимогою споживача шляхом специфічної хімічної активації. Крім того, одержання гібридного насіння може бути модернізоване при використанні хімічного контролю підтримання гібриду. Система генетичного перемикання на основі Tet репресора (TetR), що широко використовується у тваринних система, має обмежене застосування у рослинних генетичних системах частково в результаті проблем в лігандами активації. TetR було перепрофільовано для впізнання хімічної структури комерційно застосовуваних сульфонілсечовин замість тетрациклінових cполук при збереженні здатності до специфічного зв‘язування с послідовностями тетрациклінового оператора. Це було проведено шляхом модифікації домену зв‘язування ліганду Tet репресора при використання раціонального білкового моделювання та перестановки ДНК для впізнання комерційно використовуваних сполук сульфонілсечовини. Початкова перестановка TetR та скринінг при використанні чутливого in vivo -галактозидазного аналізу приводить до специфічного впізнання гербіциду Хармоні® (тифенсульфурон-метил) при концентрації 20 частин на млн. у ростовому середовищі та до втрати здатності до впізнання тетрацикліну. При проведенні аналізу з іншими сполуками сульфонілсечовини багато з цих хітів, які є реактивними стосовно Хармоні®, також реагували на інші сполуки сульфонілсечовини. У 2 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 деяких випадках хіьт мали навіть кращу реактивність стосовно гербіцидів хлорсульфурону та етаметсульфурону (2 частин на млн.). Додаткові цикли перестановки та скринінгу TetR похідних приводили до одержання TetR варіантів, що активно реагували на 0,2 частин на млн. хлорсульфурону та 0,02 частин на млн. етаметсульфурону, як було виміряно при використанні in vivo аналізів індукції E. coli. Найрезультативніші чутливі до етаметсульфурону SuR варіанти (EsRs) продемонстрували здатність до індукції майже на рівні такої для TetR дикого типу класу B при індукції за допомогою ангідротетрацикліну (atc) при використанні подібних концентрацій індуктора. Такі SuR молекули не мали реактивності стосовно тетрациклінів, а TetR(B) дикого типу (SEQ ID NO: 2) не мав реактивності стосовно сульфонілсечовин. Забезпечуються композиції та способи, що відносяться до застосування чутливих до сульфонісечовини репресорів. Чутливі до сульфонісечовини репресори (SuR) включають будьякий репресорний поліпептид, зв‘язування якого з послідовністю оператора контролюється лігандом, що включає сполуку сульфонілсечовини. У деяких прикладах репресор специфічно зв‘язується з оператором за відсутності сульфонілсечовинного ліганда. У деяких прикладах репресор специфічно зв‘язується з оператором у присутності сульфонілсечовинного ліганда. Репресори, які зв‘язуються з оператором у присутності ліганда, іноді називаються зворотними репресорами. У деяких прикладах композиції включають SuR поліпептиди, які специфічно зв‘язуються з тетрацикліновим оператором, де специфічне зв‘язування регулюється сульфонілсечовинною сполукою. У деяких прикладах композиції включають ізольований сульфонілсечовинний репресорний (SuR) поліпептид, що включає принаймні одну амінокислотну заміну у домені зв‘язування ліганду білка тетрациклінового репресора дикого типу, де SuR поліпептид, або його мультимер специфічно зв‘язується з полінуклеотидом, що включає послідовність оператора, де зв‘язування репресор-оператор регулюється відсутністю або присутністю сульфонілсечовинної сполуки. У деяких прикладах композиції включають ізольовані сульфонілсечовинні репресори, що включають домен зв‘язування ліганду, який містить принаймні одну амінокислотну заміну у домені зв‘язування ліганду білка тетрациклінового репресора дикого типу, злитого з гетерологічним зв‘язувальним доменом оператора ДНК, який специфічно зв‘язується з полінуклеотидом, який включає послідовність оператора або її похідну, де зв‘язування репресор-оператор регулюється відсутністю або присутністю сульфонілсечовинної сполуки. Може використовуватися будь-який зв‘язувальний домен оператора ДНК, включаючи, але без обмеження, зв‘язувальний домен оператора ДНК з репресорів, що містяться у tet, lac, trp, phd, arg, LexA, phiCh1 репресорі, lambda C1 та Cro репресорах, у репресорі фага X, MetJ, phir1t rro, phi434 C1 та Cro репресорах, RafR, gal, ebg, uxuR, exuR, ROS, SinR, PurR, FruR, P22 C2, TetC, AcrR, Betl, Bm3R1, EnvR, QacR, MtrR, TcmR, Ttk, YbiH, YhgD та mu Ner, або у доменах зв‘язування ДНК у Interpro родинах, включаючи, але без обмеження, IPR001647, IPR010982 та IPR011991. У деяких прикладах композиції включають ізольовані поліпептиди сульфонілсечовинного репресора (SuR), що містить принаймні одну амінокислотну заміну у білку тетрациклінового репресора дикого типу, де SuR поліпептид або його мультимер специфічно зв‘язується з полінуклеотидом, який включає послідовність тетрациклінового оператора, де зв‘язування репресор-оператор регулюється присутністю або відсутністю сульфонілсечовинної сполуки. Репресори дикого типу включають класи A, B, C, D, E, G, H, J та Z тетрациклінових репресорів. Приклад TetR(A) виявлено у Tn1721 транспозоні та задепоновано під депозитним номером GenBank X61307, перехресне посилання на gi48198, з номером доступу для білка, який кодується, CAA43639, перехресне посилання на gi48195 та UniProt депозитний номер Q56321. Приклад TetR(B) виявлено у Tn10 транспозоні та задепоновано під депозитним номером GenBank X00694, перехресне посилання на gi43052, з номером доступу для білка, який кодується, CAA25291, перехресне посилання на gi43052 та UniProt депозитний номер P04483. Приклад TetR(C) виявлено у pSC101 плазміді та задепоновано під депозитним номером GenBank M36272, перехресне посилання на gi150945, з номером доступу для білка, який кодується, AAA25677, перехресне посилання на gi150946. Приклад TetR(D) класу виявлено у Salmonella ordonez та задепоновано під депозитним номером GenBank X65876, перехресне посилання на gi49073, з номером доступу для білка, який кодується, CAA46707, перехресне посилання на gi49075 та UniProt депозитні номери P0ACT5 та P09164. Приклад TetR(E) класу було ізольовано з транспозона Tn10 E. coli та задепоновано під депозитним номером GenBank M34933, перехресне посилання на gi155019, з номером доступу для білка, який кодується, AAA98409, перехресне посилання на gi155020. Приклад TetR(G) класу було ізольовано з Vibrio anguillarium та задепоновано під депозитним номером GenBank S52438, перехресне посилання на gi262928, з номером доступу для білка, який кодується, AAB24797, перехресне посилання на gi262929. Приклад TetR(H) класу біло виявлено у плазміді pMV111, 3 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 яка ізольована з Pasteurella multocida та задепоновано під депозитним номером GenBank U00792, перехресне посилання на gi392871, з номером доступу для білка, який кодується, AAC43249, перехресне посилання на gi392872. Приклад TetR(J) класу було ізольовано з Proteus mirabilis та задепоновано під депозитним номером GenBank AF038993, перехресне посилання на gi4104704, з номером доступу для білка, який кодується, AAD12754, перехресне посилання на gi4104706. Приклад TetR(Z) класу було виявлено у плазміді pAGI, ізольованої з Corynebacterium glutamicum та задепоновано під депозитним номером GenBank AF121000, перехресне посилання на gi4583389, з номером доступу для білка, який кодується, AAD25064, перехресне посилання на gi4583390. У деяких прикладах тетрацикліновий репресор дикого типу являє собою білок тетрациклінового репресора класу B. У деяких прикладах тетрацикліновий репресор дикого типу являє собою білок тетрациклінового репресора класу D. У деяких прикладах поліпептиди сульфонілсечовинного репресора (SuR) включають амінокислотну заміну у домені зв‘язування ліганду білка тетрациклінового репресора дикого типу. У класі B та D білків TetR дикого типу амінокислотні залишки 6-52 представляють собой домен зв‘язування ДНК. Інша частина білка є втягненою у зв‘язування ліганду та подальшу алостеричну модифікацію. Для класу B TetR залишки 53-207 являють собою домен зв‘язування ліганду, у той час, як залишки 53-218 включають домен зв‘язування ліганду для класу D TetR. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну заміну у домені зв‘язування ліганду білка TetR(B) дикого типу. У деяких прикладах SuR поліпептиди містять амінокислотну заміну у домені зв‘язування ліганду білка TetR(B) дикого типу послідовності SEQ ID NO: 1. У деяких прикладах ізольовані SuR поліпептиди включають амінокислоту або будь-яку комбінацію амінокислот, що відповідає еквівалентним положенням амінокислот, вибраних з різноманітності амінокислот, показаних на Фігурі 9, де положення амінокислотного залишка, показаного на Фігурі 9, відповідає нумерації амінокислот дикого типу TetR(B). У деяких прикладах ізольовані SuR поліпептиди включають домен зв‘язування ліганду, що включає принаймні 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 55%, 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% або 100% амінокислотних залишків, показаних на Фігурі 9, де положення амінокислотного залишка відповідає еквівалентному положенню при використанні нумерації амінокислот дикого типу TetR(B). У деяких прикладах ізольовані SuR поліпептиди включають принаймні 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 55%, 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% або 100% амінокислотних залишків, показаних на Фігурі 9, де положення амінокислотного залишка відповідає еквівалентному положенню при використанні нумерації амінокислот дикого типу TetR(B). У деяких прикладах TetR(B) дикого типу являє собою SEQ ID NO: 1. У деяких прикладах ізольований SuR поліпептид включає домен зв‘язування ліганду, що містить амінокислотну заміну у положенні залишку, вибраного з групи, що складається з положень 55, 60, 64, 67, 82, 86, 100, 104, 105, 108, 113, 116, 134, 135, 138, 139, 147, 151, 170, 173, 174, 177 та будь-якої їх комбінації, де положення амінокислотного залишка та заміна відповідають еквівалентному положенню при використанні нумерації амінокислот дикого типу TetR(B). У деяких прикладах ізольований SuR поліпептид додатково включає амінокислотну заміну у положенні залишку, вибраного з групи, що складається з 109, 112, 117, 131, 137, 140, 164 та будь-якої їх комбінації. У деяких прикладах TetR(B) дикого типу являє собою SEQ ID NO: 1. У деяких прикладах ізольовані SuR поліпептиди включають домен зв‘язування ліганду, що містить принаймні 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 55%, 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% або 100% амінокислотних залишків , вибраних з групи, що складається з: (a) M або L у положенні амінокислотного залишку 55; (b) A, L або M у положенні амінокислотного залишку 60; (c) A, N, Q, L або H у положенні амінокислотного залишку 64; (d) M, I, L, V, F або Y у положенні амінокислотного залишку 67; (e) N, S або T у положенні амінокислотного залишку 82; (f) F, M, W або Y у положенні амінокислотного залишку 86; (g) C, V, L, M, F, W або Y у положенні амінокислотного залишку 100; (h) R, A або G у положенні амінокислотного залишку 104 (i) A, I, V, F або W у положенні амінокислотного залишку 105; (j) Q або K у положенні амінокислотного залишку 108; 4 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 (k) A, M, H, K, T, P або V у положенні амінокислотного залишку 113; (l) I, L, M, V, R, S, N, P або Q у положенні амінокислотного залишку 116; (m) I, L, V, M, R, S або W у положенні амінокислотного залишку 134; (n) R, S, N, Q, K або A у положенні амінокислотного залишку 135; (o) A, C, G, H, I, V, R або T у положенні амінокислотного залишку 138; (p) A, G, I, V, M, W, N, R або T у положенні амінокислотного залишку 139; (q) I, L, V, F, W, T, S або R у положенні амінокислотного залишку 147; (r) M, L, W, Y, K, R або S у положенні амінокислотного залишку 151; (s) I, L, V або A у положенні амінокислотного залишку 170; (t) A, G або V у положенні амінокислотного залишку 173; (u) L, V, W, Y, H, R, K або S у положенні амінокислотного залишку 174; та (v) A, G, I, L, Y, K, Q або S у положенні амінокислотного залишку 177, де положення амінокислотного залишка відповідає еквівалентному положенню при використанні нумерації амінокислот TetR(B) дикого типу. У деяких прикладах ізольовані SuR поліпептиди включають принаймні 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 55%, 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% або 100% амінокислотних залишків, які є вибраними з амінокислотних залишків, приведених у (a) – (v) вище, де положення амінокислотного залишку відповідає еквівалентному положенню при використанні нумерації амінокислот дикого типу TetR(B). У деяких прикладах TetR(B) дикого типу являє собою SEQ ID NO: 1. У деяких прикладах ізольовані SuR поліпептиди, вибрані для поліпшення активності стосовно хлорсульфурону, включають домен зв‘язування ліганду, що включає принаймні 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 55%, 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% або 100% амінокислотних залишків, вибраних з групи, що складається з: (a) M у положенні амінокислотного залишку 60; (b) A або Q у положенні амінокислотного залишку 64; (c) M, F, Y, I, V або L у положенні амінокислотного залишку 67; (d) N або T у положенні амінокислотного залишку 82; (e) M у положенні амінокислотного залишку 86; (f) C або W у положенні амінокислотного залишку 100; (g) W у положенні амінокислотного залишку 105; (h) Q або K у положенні амінокислотного залишку 108; (i) M, Q, L або H у положенні амінокислотного залишку 109; (j) G, A, S або T у положенні амінокислотного залишку 112; (k) A у положенні амінокислотного залишку 113; (l) M або Q у положенні амінокислотного залишку 116; (m) M або V у положенні амінокислотного залишку 134; (n) G або R у положенні амінокислотного залишку 138; (o) N або V у положенні амінокислотного залишку 139; (p) F у положенні амінокислотного залишку 147; (q) S або L у положенні амінокислотного залишку 151; (r) A у положенні амінокислотного залишку 164; (s) A, L або V у положенні амінокислотного залишку 170; (t) A, G або V у положенні амінокислотного залишку 173; (u) L або W у положенні амінокислотного залишку 174; та (v) K у положенні амінокислотного залишку 177, де положення амінокислотного залишка відповідає еквівалентному положенню при використанні нумерації амінокислот TetR(B) дикого типу. У деяких прикладах ізольовані SuR поліпептиди включають принаймні 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 55%, 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% або 100% амінокислотних залишків, які є вибраними з амінокислотних залишків, приведених у (a) – (v) вище, де положення амінокислотного залишку відповідає еквівалентному положенню при використанні нумерації амінокислот TetR(B) дикого типу. У деяких прикладах TetR(B) дикого типу являє собою SEQ ID NO: 1. У деяких прикладах ізольовані SuR поліпептиди, вибрані для поліпшення активності стсовно етаметсульфурону, включають домен зв‘язування ліганду, що включає принаймні 10%, 20%, 5 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 30%, 40%, 50%, 55%, 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% або 100% амінокислотних залишків, які є вибраними з групи, що складається з: (a) M або L у положенні амінокислотного залишку 55; (b) A у положенні амінокислотного залишку 64; (c) M, Y, F, I, L або V у положенні амінокислотного залишку 67; (d) M у положенні амінокислотного залишку 86; (e) C у положенні амінокислотного залишку 100; (f) G у положенні амінокислотного залишку 104; (g) F у положенні амінокислотного залишку 105; (h) Q або K у положенні амінокислотного залишку 108; (i) Q, M, L або H у положенні амінокислотного залишку 109; (j) S, T, G або A у положенні амінокислотного залишку 112; (k) A у положенні амінокислотного залишку 113; (l) S у положенні амінокислотного залишку 116; (m) M або L у положенні амінокислотного залишку 117; (n) M або L у положенні амінокислотного залишку 131; (o) M у положенні амінокислотного залишку 134; (p) Q у положенні амінокислотного залишку 135; (q) A або V у положенні амінокислотного залишку 137; (r) C або G у положенні амінокислотного залишку 138; (s) I у положенні амінокислотного залишку 139; (t) F або Y у положенні амінокислотного залишку 140; (u) L у положенні амінокислотного залишку 147; (v) L у положенні амінокислотного залишку 151; (w) A у положенні амінокислотного залишку 164; (x) V, A або L у положенні амінокислотного залишку 170; (y) G, A або V у положенні амінокислотного залишку 173 (z) L у положенні амінокислотного залишку 174; та (aa) N або K у положенні амінокислотного залишку 177, де положення амінокислотного залишка відповідає еквівалентному положенню при використанні нумерації амінокислот TetR(B ) дикого типу. У деяких прикладах ізольовані SuR поліпептиди включають принаймні 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 55%, 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% або 100% амінокислотних залишків, які є вибраними з амінокислотних залишків, приведених у (a) – (aa) вище, де положення амінокислотного залишку відповідає еквівалентному положенню при використанні нумерації амінокислот TetR(B ) дикого типу. У деяких прикладах TetR(B ) дикого типу являє собою SEQ ID NO: 1. У деяких прикладах ізольований SuR поліпептид має принаймні приблизно 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності до домену, що зв‘язує ліганд, TetR(B) дикого типу , що представлений амінокислотними залишками 53-207 SEQ ID NO: 1, де ідентичністьі послідовності визначається на повній довжині домену зв‘язування ліганду при використанні способу універсального вирівнювання. У деяких прикладах спосіб універсального вирівнювання використовує GAP алгоритм з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах ізольований SuR поліпептид має принаймні приблизно 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності з TetR(B) дикого типу, представленим SEQ ID NO: 1, де ідентичність послідовності визначається на повній довжині поліпептиду при використанні способу універсального вирівнювання. У деяких прикладах спосіб універсального вирівнювання використовує GAP алгоритм з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послдовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. Композиції включають ізольовані SuR поліпептиди, що мають принаймні приблизно 50% 6 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності до домену, що зв‘язує ліганд, SuR поліпептиду, вибраного з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243, де ідентичність послідовності визначається на повній довжині домену зв‘язування ліганду при використанні способу універсального вирівнювання. У деяких прикладах спосіб універсального вирівнювання використовує GAP алгоритм з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах ізольовані SuR поліпептид має принаймні приблизно 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності до SuR поліпептиду, вибраного з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243, де ідентичність послідовності визначається на повній довжині поліпептиду при використанні способу універсального вирівнювання. У деяких прикладах спосіб універсального вирівнювання використовує GAP алгоритм з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бти оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L7-1A04 (SEQ ID NO:220) з одержанням біт показника BLAST принаймні 200, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700 або 750, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L7-1A04 (SEQ ID NO:220) з одержанням біт показника BLAST принаймні 374, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовність L7-1A04 (SEQ ID NO:220) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L7-1A04 (SEQ ID NO:220) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 88% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах процент ідентичності визначають при використанні способу універсального вирівнювання при використанні GAP алгоритму з параметрами по умовчанню % ідентичності амінокислотної послідовність та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовність L7-1A04 (SEQ ID NO:220) з одержанням значення BLAST подібності принаймні 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 750, 800, 850, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990, 1000, 1010, 1020, 1030, 1040, 1050, 1060, 1070, 1080, 1090, 1100, 1110, 1120, 1130, 1140, 1150, 1160, 1170, 1180, 1190 або 1200, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L7-1A04 (SEQ ID NO:220) з одержанням BLAST e-показника принаймні e-60, e-70, e-75, e-80, e-85, e-90, e-95, e-100, e-105, e-106, e-107, e-108, e-109, e-110, e-111, e-112, e-113, e-114, e-115, e-116, e-117, e-118, e-119, e120 або e-125, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах поліпептид є вибраним з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-22 (SEQ ID NO: 7) з одержанням BLAST показника принаймні 200, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700 або 750, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, 7 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-22 (SEQ ID NO: 7) з одержанням біт показника BLAST принаймні 387, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-22 (SEQ ID NO: 7) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-22 (SEQ ID NO: 7) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 92%, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах процент ідентичності визначають при використанні способу універсального вирівнювання при використанні GAP алгоритму з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-22 (SEQ ID NO: 7) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 750, 800, 850, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990, 1000, 1010, 1020, 1030, 1040, 1050, 1060, 1070, 1080, 1090, 1100, 1110, 1120, 1130, 1140, 1150, 1160, 1170, 1180, 1190 або 1200, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-22 (SEQ ID NO: 7) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-60, e-70, e-75, e-80, e-85, e-90, e-95, e-100, e-105, e-106, e-107, e-108, e-109, e-110, e-111, e-112, e113, e-114, e-115, e-116, e-117, e-118, e-119, e-120 або e-125, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах поліпептид є вибраним з групи, що складається з SEQ ID NO: 3401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-29 (SEQ ID NO: 10) з одержанням біт показника BLAST принаймні 200, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700 або 750, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-29 (SEQ ID NO: 10) з одержанням біт показника BLAST принаймні 393, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-29 (SEQ ID NO: 10) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах процент ідентичності визначають при використанні способу універсального вирівнювання при використанні GAP алгоритму з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-29 (SEQ ID NO: 10) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 750, 800, 850, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990, 1000, 1010, 1020, 1030, 1040, 1050, 1060, 1070, 1080, 1090, 1100, 1110, 1120, 1130, 1140, 1150, 1160, 1170, 1180, 1190 або 1200, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У 8 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-29 (SEQ ID NO: 10) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 1006, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-29 (SEQ ID NO: 10) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-60, e-70, e-75, e-80, e-85, e-90, e-95, e-100, e-105, e-106, e-107, e108, e-109, e-110, e-111, e-112, e-113, e-114, e-115, e-116, e-117, e-118, e-119, e-120 або e-125, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1.У деяких прикладах поліпептид є вибраним з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-02 (SEQ ID NO: 3) з одержанням біт показника BLAST принаймні 200, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, або 750, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-02 (SEQ ID NO: 3) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах процент ідентичності визначають при використанні способу універсального вирівнювання при використанні GAP алгоритму з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-02 (SEQ ID NO: 3) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 750, 800, 850, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990, 1000, 1010, 1020, 1030, 1040, 1050, 1060, 1070, 1080, 1090, 1100, 1110, 1120, 1130, 1140, 1150, 1160, 1170, 1180, 1190 або 1200 де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-02 (SEQ ID NO: 3) з одержанням eзначення показника BLAST принаймні e-60, e-70, e-75, e-80, e-85, e-90, e-95, e-100, e-105, e-106, e-107, e-108, e-109, e-110, e-111, e-112, e-113, e-114, e-115, e-116, e-117, e-118, e-119, e-120 або e-125, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-02 (SEQ ID NO: 3) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e112, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах поліпептид є вибраним з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-07 (SEQ ID NO: 4) з одержанням біт показника BLAST принаймні 200, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, або 750, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-07 (SEQ ID NO: 4) з одержанням біт показника BLAST принаймні 388, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-07 (SEQ ID NO: 4) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR 9 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-07 (SEQ ID NO: 4) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 93% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах процент ідентичності визначають при використанні способу універсального вирівнювання при використанні GAP алгоритму з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-07 (SEQ ID NO: 4) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 750, 800, 850, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990, 1000, 1010, 1020, 1030, 1040, 1050, 1060, 1070, 1080, 1090, 1100, 1110, 1120, 1130, 1140, 1150, 1160, 1170, 1180, 1190 або 1200, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-07 (SEQ ID NO: 4) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 996, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-07 (SEQ ID NO: 4) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-60, e-70, e-75, e-80, e-85, e-90, e-95, e-100, e-105, e-106, e-107, e108, e-109, e-110, e-111, e-112, e-113, e-114, e-115, e-116, e-117, e-118, e-119, e-120 або e-125, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-07 (SEQ ID NO: 4) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e111, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах поліпептид є вибраним з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-20 (SEQ ID NO: 6) з одержанням біт показника BLAST принаймні 200, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, або 750, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-20 (SEQ ID NO: 6) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-20 (SEQ ID NO: 6) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 93% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах процент ідентичності визначають при використанні способу універсального вирівнювання при використанні GAP алгоритму з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-20 (SEQ ID NO: 6) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 750, 800, 850, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990, 1000, 1010, 1020, 1030, 1040, 1050, 1060, 1070, 1080, 1090, 1100, 1110, 1120, 1130, 1140, 1150, 1160, 1170, 1180, 1190 або 1200, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-20 (SEQ ID NO: 6) з одержанням eзначення показника BLAST принаймні e-60, e-70, e-75, e-80, e-85, e-90, e-95, e-100, e-105, e-106, 10 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 e-107, e-108, e-109, e-110, e-111, e-112, e-113, e-114, e-115, e-116, e-117, e-118, e-119, e-120 або e-125, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-20 (SEQ ID NO: 6) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e111, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах поліпептид є вибраним з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-44 (SEQ ID NO: 13) з одержанням біт показника BLAST принаймні 200, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700 або 750, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-44 (SEQ ID NO: 13) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-44 (SEQ ID NO: 13) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 93% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах процент ідентичності визначають при використанні способу універсального вирівнювання при використанні GAP алгоритму з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-44 (SEQ ID NO: 13) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 750, 800, 850, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990, 1000, 1010, 1020, 1030, 1040, 1050, 1060, 1070, 1080, 1090, 1100, 1110, 1120, 1130, 1140, 1150, 1160, 1170, 1180, 1190 або 1200, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-44 (SEQ ID NO: 13) з одержанням eзначення показника BLAST принаймні e-60, e-70, e-75, e-80, e-85, e-90, e-95, e-100, e-105, e-106, e-107, e-108, e-109, e-110, e-111, e-112, e-113, e-114, e-115, e-116, e-117, e-118, e-119, e-120 або e-125, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах поліпептид є вибраним з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L6-3A09 (SEQ ID NO: 1228) з одержанням біт показника BLAST принаймні 200, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700 або 750, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L6-3A09 (SEQ ID NO: 1228) з одержанням біт показника BLAST принаймні 381, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L6-3A09 (SEQ ID NO: 1228) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах процент ідентичності визначають при використанні способу універсального вирівнювання при використанні GAP алгоритму з параметрами по умовчанню для % 11 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L6-3A09 (SEQ ID NO: 1228) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 750, 800, 850, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990, 1000, 1010, 1020, 1030, 1040, 1050, 1060, 1070, 1080, 1090, 1100, 1110, 1120, 1130, 1140, 1150, 1160, 1170, 1180, 1190 або 1200, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L6-3A09 (SEQ ID NO: 1228) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 978, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L6-3A09 (SEQ ID NO: 1228) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-60, e-70, e-75, e-80, e-85, e-90, e-95, e-100, e-105, e106, e-107, e-108, e-109, e-110, e-111, e-112, e-113, e-114, e-115, e-116, e-117, e-118, e-119, e120 або e-125, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L6-3A09 (SEQ ID NO: 1228) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-108, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах поліпептид є вибраним з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L6-3H02 (SEQ ID NO: 94) з одержанням біт показника BLAST принаймні 200, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700 або 750, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L6-3H02 (SEQ ID NO: 94) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L6-3H02 (SEQ ID NO: 94) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 90% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах процент ідентичності визначають при використанні способу універсального вирівнювання при використанні GAP алгоритму з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L6-3H02 (SEQ ID NO: 94) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 750, 800, 850, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990, 1000, 1010, 1020, 1030, 1040, 1050, 1060, 1070, 1080, 1090, 1100, 1110, 1120, 1130, 1140, 1150, 1160, 1170, 1180, 1190 або 1200, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L6-3H02 (SEQ ID NO: 94) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-60, e-70, e-75, e-80, e-85, e-90, e-95, e100, e-105, e-106, e-107, e-108, e-109, e-110, e-111, e-112, e-113, e-114, e-115, e-116, e-117, e118, e-119, e-120 або e-125, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах поліпептид є вибраним з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L7-4E03 (SEQ ID NO: 1229) з одержанням біт показника BLAST принаймні 200, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 12 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700 або 750, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L7-4E03 (SEQ ID NO: 1229) з одержанням біт показника BLAST принаймні 368, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L7-4E03 (SEQ ID NO: 1229) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах процент ідентичності визначають при використанні способу універсального вирівнювання при використанні GAP алгоритму з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L7-4E03 (SEQ ID NO: 1229) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 750, 800, 850, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990, 1000, 1010, 1020, 1030, 1040, 1050, 1060, 1070, 1080, 1090, 1100, 1110, 1120, 1130, 1140, 1150, 1160, 1170, 1180, 1190 або 1200, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L7-4E03 (SEQ ID NO: 1229) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 945 де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L7-4E03 (SEQ ID NO: 1229) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-60, e-70, e-75, e-80, e-85, e-90, e-95, e-100, e-105, e106, e-107, e-108, e-109, e-110, e-111, e-112, e-113, e-114, e-115, e-116, e-117, e-118, e-119, e120, або e-125, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L7-4E03 (SEQ ID NO: 1229) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-105, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах поліпептид є вибраним з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L10-84(B12) (SEQ ID NO: 1230) з одержанням біт показника BLAST принаймні 200, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, або 750, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L10-84(B12) (SEQ ID NO: 1230) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L10-84(B12) (SEQ ID NO: 1230) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 86% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах процент ідентичності визначають при використанні способу універсального вирівнювання при використанні GAP алгоритму з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути 13 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L10-84(B12) (SEQ ID NO: 1230) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 750, 800, 850, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990, 1000, 1010, 1020, 1030, 1040, 1050, 1060, 1070, 1080, 1090, 1100, 1110, 1120, 1130, 1140, 1150, 1160, 1170, 1180, 1190 або 1200, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L10-84(B12) (SEQ ID NO: 1230) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-60, e-70, e-75, e-80, e-85, e-90, e-95, e-100, e-105, e-106, e-107, e-108, e-109, e-110, e-111, e-112, e-113, e-114, e-115, e-116, e-117, e-118, e-119, e-120, або e-125, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах поліпептид є вибраним з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L13-46 (SEQ ID NO: 1231) з одержанням біт показника BLAST принаймні 200, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, або 750, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L13-46 (SEQ ID NO: 1231) з одержанням біт показника BLAST принаймні 320, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L13-46 (SEQ ID NO: 1231) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L13-46 (SEQ ID NO: 1231) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 86% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах процент ідентичності визначають при використанні способу універсального вирівнювання при використанні GAP алгоритму з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L13-46 (SEQ ID NO: 1231) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 750, 800, 850, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990, 1000, 1010, 1020, 1030, 1040, 1050, 1060, 1070, 1080, 1090, 1100, 1110, 1120, 1130, 1140, 1150, 1160, 1170, 1180, 1190 або 1200, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L13-46 (SEQ ID NO: 1231) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 819, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L13-46 (SEQ ID NO: 1231) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-60, e-70, e-75, e-80, e-85, e-90, e-95, e-100, e-105, e106, e-107, e-108, e-109, e-110, e-111, e-112, e-113, e-114, e-115, e-116, e-117, e-118, e-119, e120 або e-125, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, що може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L13-46 (SEQ ID NO: 1231) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-90, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах поліпептид є вибраним з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах ізольовані SuR поліпептиди включають домен зв‘язування ліганду з 14 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 поліпептиду, вибраного з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах ізольовані SuR поліпептиди включають амінокислотну послідовність, вибрану з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах ізольований SuR поліпептид є вибраним з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243, а сполука сульфонілсечовини є вибраною з групи, що складається з хлорсульфурону, етаметсульфурону, метсульфурону, сульфометурону, трибенурону, хлоримурону, нікосульфурону, римсульфурону та тифенсульфурону. У деяких прикладах ізольовані SuR поліпептиди мають рівноважну константу зв‘язування для сполуки сульфонілсечовини більшу за 0,1 нМ та меншу за 10 мкМ. У деяких прикладах ізольований SuR поліпептид має рівноважну константу зв‘язування для сполуки сульфонілсечовини принаймні 0,1 нМ, 0,5 нМ, 1 нМ, 10 нМ, 50 нМ, 100 нМ, 250 нМ, 500 нМ, 750 нМ, 1 мкМ, 5 мкМ, 7 мкМ, але меншу за 10 мкМ. У деяких прикладах ізольований SuR поліпептид має рівноважну константу зв‘язування для сполуки сульфонілсечовини принаймні 0,1 нМ, 0,5 нМ, 1 нМ, 10 нМ, 50 нМ, 100 нМ, 250 нМ, 500 нМ, 750 нМ, але меншу за 1 мкМ. У деяких прикладах ізольований SuR поліпептид має рівноважну константу зв‘язування для сполуки сульфонілсечовини більшу за 0 нМ, але меншу за 0,1 нМ, 0,5 нМ, 1 нМ, 10 нМ, 50 нМ, 100 нМ, 250 нМ, 500 нМ, 750 нМ, 1 мкМ, 5 мкМ, 7 мкМ або 10 мкМ. У деяких прикладах сполука сульфонілсечовини являє собою хлорсульфурон, етаметсульфурон, метсульфурон, сульфометурон, трибенурон, хлоримурон, нікосульфурон, римсульфурон та/або тифенсульфурон. У деяких прикладах ізольовані SuR поліпептиди мають рівноважну константу зв‘язування для послідовності оператора більшу за 0,1 нМ та меншу за 10 мкМ. У деяких прикладах ізольований SuR поліпептид має рівноважну константу зв‘язування для послідовності оператора принаймні 0,1 нМ, 0,5 нМ, 1 нМ, 10 нМ, 50 нМ, 100 нМ, 250 нМ, 500 нМ, 750 нМ, 1 мкМ, 5 мкМ, 7 мкМ, але меншу за 10 мкМ. У деяких прикладах ізольований SuR поліпептид має рівноважну константу зв‘язування для послідовності оператора принаймні 0,1 нМ, 0,5 нМ, 1 нМ, 10 нМ, 50 нМ, 100 нМ, 250 нМ, 500 нМ, 750 нМ, але меншу за 1 мкМ. У деяких прикладах ізольований SuR поліпептид має рівноважну константу зв‘язування для послідовності оператора більшу за 0 нМ, але меншу за 0,1 нМ, 0,5 нМ, 1 нМ, 10 нМ, 50 нМ, 100 нМ, 250 нМ, 500 нМ, 750 нМ, 1 мкМ, 5 мкМ, 7 мкМ або 10 мкМ. У деяких прикладах послідовність оператора являє собою послідовність Tet оператора. У деяких прикладах послідовність Tet оператора являє собою послідовність TetR(A) оператора, послідовність TetR(B) оператора, послідовність TetR(D) оператора, послідовність TetR(E) оператора, послідовність TetR(H) оператора або їх функціональну похідну. Ізольовані SuR поліпептиди специфічно зв‘язуються з сполукою сульфонілсечовини. Молекули сульфонілсечовини включають залишок сульфонілсечовини (–S(O)2NHC(O)NH(R)–). У сульфонілсечовинних гербіцидах сульфонільний кінець сульфонілсечовинного залишку є зв‘язаним або безпосередньо або за допомогою атома кисню, або необов‘язково заміщеної групи аміно або групи метилену з типово заміщеноб циклічною або ациклічною групою. На протилежному кінці містка сульфонілсечовини аміногрупа, яка може мати замісник, такий, як метил (R являє собою CH3) замість водню, є зв‘язаною з гетероциклічною групою, типово, симетричним піримідиновим або триазиновим кільцем, що має один або два замісники, такі, як such as метил, етил, трифторметил, метокси, етокси, метиламіно, диметиламіно, етиламіно та галогени. Сульфонілсечовинні гербіциди можуть бути у формі вільної кислоти або солі. У формі вільної кислоти сульфонамідний азот у містку не є депротонованим (тобто, – S(O)2NHC(O)NH(R)–), у той часяк у формі солі сульфонамідний атом азоту у містку є депротонованим (тобто, –S(O)2NНC(O)NH(R)–), та є присутнім катіон, типово лужного металу або лужноземельного металу, у загальному випадку, натрію або калію. Сполуки сульфонілсечовини включають, наприклад, класи сполук, такі, як сполуки піримідинсульфонілсечовини, сполуки триазинілсульфонілсечовини, сполуки тіадіазолілсечовини, та фармацевтичні агенти, такі, як антидіабетичні лікарські засоби, а також їх солі та інші похідні. Приклади сполук піримідинілсульфонілсечовини включають амідосульфурон, aзимсульфурон, бенсульфурон, бенсульфурон-метил, хлоримурон, хлоримурон-етил, циклосульфамурон, етоксисульфурон, флазасульфурон, флуцетосульфурон, флупірсульфурон, флупіпсульфурон-метил, форамсульфурон, галосульфурон, галосульфуронметил, імазосульфурон, мезoсульфурон, мезoсульфурон-метил, нікосульфурон, ортосульфамурон, oксaсульфурон, прімісульфурон, прімісульфурон-метил, піразосульфурон, піразосульфурон-етил, римсульфурон, сульфометурон, сульфометурон-метил, сульфосульфурон, трифлоксисульфурон, а також їх солі та похідні. Приклади триазинілових 15 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 сполук сульфонілсечовини включають хлорсульфурон, цинoсульфурон, етаметсульфурон, етаметсульфурон-метил, йодосульфурон, йодoсульфурон-метил, метсульфурон, метсульфурон-метил, просульфурон, тифенсульфурон, тифенсульфурон-метил, триaсульфурон, трибенурон, трибенурон-метил, трифлусульфурон, трифлусульфурон-метил, тритосульфурон, а також їх солі та похідні. Приклади сполук тіадіазолілсечовини включають бутіурон, етідімурон, тебутіурон, тіазафлурон, тідіазурон, а також їх солі та похідні. Приклади антидіабетичних лікарських засобів включають aцетогексамід, хлорпропамід, толбутамід, толазамід, гліпізид, гліклазид, глібенкламід (глібурид), гліквідон, глімепірид, а також їх солі та похідні. У деяких прикладах ізольовані SuR поліпептиди специфічно зв‘язуються з більше, ніж одною сполукою сульфонілсечовини. У деяких прикладах сполука сульфонілсечовини є вибраною з групи, що складається з хлорсульфурону, етаметсульфурон-метилу, метсульфуронметилу, тифенсульфурон-метилу, сульфометурон-метилу, трибенурон-метилу, хлоримуронетилу, нікосульфурону та римсульфурону. Композиції також включають ізольовані полінуклеотиди, що кодують SuR поліпептиди, які специфічно зв‘язуються з тетрацикліновим оператором, де специфічне зв‘язування регулюється сполукою сульфонілсечовини. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують поліпептиди репресора сульфонілсечовини (SuR), що включає амінокислотну заміну у домені зв‘язування ліганду білка тетрациклінового репресора дикого типу. У класі B та D білків TetR дикого типу амінокислотні залишки 6-52 представляють собой домен зв‘язування ДНК. Інша частина білка є втягненою у зв‘язування ліганду та подальшу алостеричну модифікацію. Для класу B TetR залишки 53-207 являють собою домен зв‘язування ліганду, у той час, як залишки 53-218 включають домен зв‘язування ліганду для класу D TetR. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну заміну у домені зв‘язування ліганду білка TetR(B) дикого типу. У деяких прикладах полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну заміну у домені зв‘язування ліганду білка TetR(B) дикого типу послідовності SEQ ID NO: 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислоту, або будь-яку комбінацію амінокислот, вибраних з різноманітності амінокислот, показаних на Фігурі 9, де положення амінокислотного залишка відповідає еквівалентному положенню при використанні нумерації амінокислот TetR(B ) дикого типу, як представлено послідовністю SEQ ID NO: 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають домен зв‘язування ліганду, який містить принаймні 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 55%, 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% або 100% амінокислотних залишків, показаних на Фігурі 9, де положення амінокислотного залишка відповідає еквівалентному положенню при використанні нумерації амінокислот TetR(B ) дикого типу. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають принаймні 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 55%, 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% або 100% амінокислотних залишків, показаних на Фігурі 9, де положення амінокислотного залишка відповідає еквівалентному положенню при використанні нумерації амінокислот TetR(B ) дикого типу. У деяких прикладах TetR(B ) дикого типу являє собою SEQ ID NO: 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають домен зв‘язування ліганду, який містить амінокислотну заміну у положенні залишку, вибраного з групи, що складається з положень 55, 60, 64, 67, 82, 86, 100, 104, 105, 108, 113, 116, 134, 135, 138, 139, 147, 151, 170, 173, 174, 177 та будь-якої їх комбінації, де положення амінокислотного залишка та заміна відповідає еквівалентному положенню при використанні нумерації амінокислот TetR(B ) дикого типу. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що додатково включають амінокислотну заміну у положенні залишку, вибраного з групи, що складається з 109, 112, 117, 131, 137, 140, 164 та будь-якої їх комбінації. У деяких прикладах послідовність поліпептиду TetR(B ) дикого типу являє собою SEQ ID NO: 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що мають домен зв‘язування ліганду, який включає принаймні 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 55%, 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% або 100% амінокислотних залишків, які є вибраними з групи, що складається з: (a) M або L у положенні амінокислотного залишку 55; (b) A, L або M у положенні амінокислотного залишку 60; (c) A, N, Q, L або H у положенні амінокислотного залишку 64; 16 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 (d) M, I, L, V, F або Y у положенні амінокислотного залишку 67; (e) N, S або T у положенні амінокислотного залишку 82; (f) F, M, W або Y у положенні амінокислотного залишку 86; (g) C, V, L, M, F, W або Y у положенні амінокислотного залишку 100; (h) R, A або G у положенні амінокислотного залишку 104 (i) A, I, V, F або W у положенні амінокислотного залишку 105; (j) Q або K у положенні амінокислотного залишку 108; (k) A, M, H, K, T, P або V у положенні амінокислотного залишку 113; (l) I, L, M, V, R, S, N, P або Q у положенні амінокислотного залишку 116; (m) I, L, V, M, R, S або W у положенні амінокислотного залишку 134; (n) R, S, N, Q, K або A у положенні амінокислотного залишку 135; (o) A, C, G, H, I, V, R або T у положенні амінокислотного залишку 138; (p) A, G, I, V, M, W, N, R або T у положенні амінокислотного залишку 139; (q) I, L, V, F, W, T, S або R у положенні амінокислотного залишку 147; (r) M, L, W, Y, K, R або S у положенні амінокислотного залишку 151; (s) I, L, V або A у положенні амінокислотного залишку 170; (t) A, G або V у положенні амінокислотного залишку 173; (u) L, V, W, Y, H, R, K або S у положенні амінокислотного залишку 174; та (v) A, G, I, L, Y, K, Q або S у положенні амінокислотного залишку 177, де положення амінокислотного залишка відповідає еквівалентному положенню при використанні нумерації амінокислот TetR(B ) дикого типу. У деяких прикладах ізольовані SuR полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають принаймні 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 55%, 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% або 100% амінокислотних залишків, що є вибраними з амінокислотних залишків, приведених у (a) – (v) вище, де положення амінокислотного залишка відповідає еквівалентному положенню при використанні нумерації амінокислот TetR(B ) дикого типу. У деяких прикладах TetR(B ) дикого типу являє собою SEQ ID NO: 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, вибрані для поліпшення впливу стосовно хлорсульфурону, що мають домен зв‘язування ліганду, який включає принаймні 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 55%, 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% або 100% амінокислотних залишків, вибраних з групи, що складається з: (a) M у положенні амінокислотного залишку 60; (b) A або Q у положенні амінокислотного залишку 64; (c) M, F, Y, I, V або L у положенні амінокислотного залишку 67; (d) N або T у положенні амінокислотного залишку 82; (e) M у положенні амінокислотного залишку 86; (f) C або W у положенні амінокислотного залишку 100; (g) W у положенні амінокислотного залишку 105; (h) Q або K у положенні амінокислотного залишку 108; (i) M, Q, L або H у положенні амінокислотного залишку 109; (j) G, A, S або T у положенні амінокислотного залишку 112; (k) A у положенні амінокислотного залишку 113; (l) M або Q у положенні амінокислотного залишку 116; (m) M або V у положенні амінокислотного залишку 134; (n) G або R у положенні амінокислотного залишку 138; (o) N або V у положенні амінокислотного залишку 139; (p) F у положенні амінокислотного залишку 147; (q) S або L у положенні амінокислотного залишку 151; (r) A у положенні амінокислотного залишку 164; (s) A, L або V у положенні амінокислотного залишку 170; (t) A, G або V у положенні амінокислотного залишку 173; (u) L або W у положенні амінокислотного залишку 174; та (v) K у положенні амінокислотного залишку 177, де положення амінокислотного залишка відповідає еквівалентному положенню при використанні нумерації амінокислот TetR(B ) дикого типу. У деяких прикладах ізольовані SuR полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають принаймні 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 55%, 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 17 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% або 100% амінокислотних залишків, що є вибраними з амінокислотних залишків, приведених у (a) – (v) вище, де положення амінокислотного залишка відповідає еквівалентному положенню при використанні нумерації амінокислот TetR(B ) дикого типу. У деяких прикладах TetR(B ) дикого типу являє собою SEQ ID NO: 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, вибрані для поліпшення впливу стосовно етаметсульфурону, що мають домен зв‘язування ліганду, який включає принаймні 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 55%, 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% або 100% амінокислотних залишків, вибраних з групи, що складається з: (a) M або L у положенні амінокислотного залишку 55; (b) A у положенні амінокислотного залишку 64; (c) M, Y, F, I, L або V у положенні амінокислотного залишку 67; (d) M у положенні амінокислотного залишку 86; (e) C у положенні амінокислотного залишку 100; (f) G у положенні амінокислотного залишку 104; (g) F у положенні амінокислотного залишку 105; (h) Q або K у положенні амінокислотного залишку 108; (i) Q, M, L або H у положенні амінокислотного залишку 109; (j) S, T, G або A у положенні амінокислотного залишку 112; (k) A у положенні амінокислотного залишку 113; (l) S у положенні амінокислотного залишку 116; (m) M або L у положенні амінокислотного залишку 117; (n) M або L у положенні амінокислотного залишку 131; (o) M у положенні амінокислотного залишку 134; (p) Q у положенні амінокислотного залишку 135; (q) A або V у положенні амінокислотного залишку 137; (r) C або G у положенні амінокислотного залишку 138; (s) I у положенні амінокислотного залишку 139; (t) F або Y у положенні амінокислотного залишку 140; (u) L у положенні амінокислотного залишку 147; (v) L у положенні амінокислотного залишку 151; (w) A у положенні амінокислотного залишку 164; (x) V, A або L у положенні амінокислотного залишку 170; (y) G, A або V у положенні амінокислотного залишку 173; (z) L у положенні амінокислотного залишку 174; та (aa) N або K у положенні амінокислотного залишку 177, де положення амінокислотного залишка відповідає еквівалентному положенню при використанні нумерації амінокислот TetR(B ) дикого типу. У деяких прикладах ізольовані SuR полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають принаймні 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 55%, 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% або 100% амінокислотних залишків, що є вибраними з амінокислотних залишків, приведених у (a) – (aa) вище, де положення амінокислотного залишка відповідає еквівалентному положенню при використанні нумерації амінокислот TetR(B ) дикого типу. У деяких прикладах TetR(B ) дикого типу являє собою SEQ ID NO: 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що мають принаймні приблизно 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності до домену зв‘язування ліганду, показані як амінокислотні залишки 53-207 послідовності SEQ ID NO: 1, де ідентичність послідовності визначається на повній довжині домену зв‘язування ліганду при використанні способу універсального вирівнювання. У деяких прикладах спосіб універсального вирівнювання являє собою GAP, де параметри по умовчанню являють собою для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності такі при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що мають принаймні приблизно 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 18 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності до SEQ ID NO: 1, де ідентичність послідовності визначається на повній довжині поліпептиду при використанні способу універсального вирівнювання. У деяких прикладах спосіб універсального вирівнювання являє собою GAP, де параметри по умовчанню являють собою для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності такі при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди включають nпослідовності нуклеїнової кислоти, що селективно гібридизуються при жорстких умовах гібридизації з полінуклеотидом, який кодує SuR поліпептид. Полінуклеотиди, що селективно гібридизуються, являють собою полінуклеотиди які зв‘язуються з цільовою послідовністю при принаймні 2-кратному рівні стосовно фону у порівнянні з гібридизацією з нецільовою послідовністю. Жорсткі умови є залежними від послідовності та залежними від умов. Типові жорсткі умови являють собою такі, в яких концентрація солі складає приблизно від 0,01 дo 1,0 M при pH 7,0-8,3 при температурі 30°C для коротких зондів (наприклад, від 10 дo 50 нуклеотидів) або приблизно 60°C для довгих зондів (наприклад, більших за 50 нуклеотидів). Жорсткі умови можуть включати формамід або інші дестабілізуючі агенти. Приклади умов помірної жорсткості включають гібридизацію у 40 45% формаміді, 1 M NaCl, 1% SDS при 37°C та промивання у 0,5X - 1X SSC при температурі 55 - 60°C. Приклади умов високої жорсткості включають гібридизацію у 50% формаміді, 1 M NaCl, 1% SDS при температурі 37°C та промивання у 0,1X SSC при темпратурі 60 - 65°C. Специфіність піддається впливу за допомогою пост-гібридизаційних умов промивання, типово, шляхом модифікації іонної сили та температури. Для гібридів ДНК-ДНК Tm може бути приблизно виражена за допомогою рівняння Мейнкота та Уола, (1984) Anal. Biochem. 138: 267284: Tm = 81,5°C + 16,6 (log M) + 0,41 (%GC) - 0,61 (% форм.) - 500/л; де M являє собою молярність моновалентних катіонів, %GC являє собою процент гуанозинових та цитозинових нуклеотидів у ДНК, % форм. є процентним вмістом формаміду у гібридизаційному розчині, а L є довжиною гібриду у парах основ. Детальне керівництво стосовно гібридизації нуклеїнових кислот можна знайти у Tijssen, Laboratory Techniques in Biochemistry and Molecular Biology-Hybridization with Nucleic Acid Probes, Частина I, Глава 2 "Overview of principles of hybridization and the strategy of nucleic acid probe assays", Elsevier, New York (1993); та Current Protocols in Molecular Biology, Глава 2, Ausubel, та ін. ред., Greene Publishing and Wiley-Interscience, New York (1995). У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди, що кодують SuR поліпептиди, специфічно гібридизуються з полінуклеотидом SEQ ID NO: 434-832, 1214-1221, 1234-1239 або 1244-1247 за умов помірної жорсткості або за умов високої жорсткості. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептид, що включає амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L7-1A04 (SEQ ID NO: 220) з одержанням біт показника BLAST принаймні 200, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, або 750, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептид, що включає амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L7-1A04 (SEQ ID NO: 220) з одержанням біт показника BLAST принаймні 374, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L7-1A04 (SEQ ID NO:220) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L7-1A04 (SEQ ID NO:220) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 88%, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах процент ідентичності визначають при використанні способу універсального вирівнювання за допомогою GAP алгоритму з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну 19 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L7-1A04 (SEQ ID NO:220) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 600, 750, 800, 850, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990, 1000, 1010, 1020, 1030, 1040, 1050, 1060, 1070, 1080, 1090, 1100, 1110, 1120, 1130, 1140, 1150, 1160, 1170, 1180, 1190 або 1200, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L7-1A04 (SEQ ID NO:220) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-60, e-70, e-80, e-85, e90, e-95, e-100, e-105, e-106, e-107, e-108, e-109, e-110, e-111, e-112, e-113, e-114, e-115, e-116, e-117, e-118, e-119, e-120 або e-125, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольований полінуклеотид кодує поліпептид, вибраний з групи, що складається з SEQ ID NO: 3401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди включають полінуклеотидну послідовність SEQ ID NO: 434-832, 1214-1221, 1234-1239 або 12441247, або комплементарну їй полінуклеотидну послідовність. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептид, що включає амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-22 (SEQ ID NO: 7) з одержанням біт показника BLAST принаймні 200, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700 або 750, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептид, що включає амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-22 (SEQ ID NO: 7) з одержанням біт показника BLAST принаймні 387, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-22 (SEQ ID NO: 7) з одержанням процентного значення ідентичності послідовності принаймні 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-22 (SEQ ID NO: 7) з одержанням процентного значення ідентичності послідовності принаймні 92% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах процент ідентичності послідовності визначають за допомогою способу універсального вирівнювання при використанні GAP алгоритму з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-22 (SEQ ID NO: 7) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 600, 750, 800, 850, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990, 1000, 1010, 1020, 1030, 1040, 1050, 1060, 1070, 1080, 1090, 1100, 1110, 1120, 1130, 1140, 1150, 1160, 1170, 1180, 1190 або 1200, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-22 (SEQ ID NO: 7) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-60, e-70, e-80, e-85, e-90, e-95, e-100, e105, e-106, e-107, e-108, e-109, e-110, e-111, e-112, e-113, e-114, e-115, e-116, e-117, e-118, e119, e-120 або e-125, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольований полінуклеотид кодує поліпептид, вибраний з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 12061213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди включають полінуклеотидну послідовність SEQ ID NO: 434-832, 1214-1221, 1234-1239 або 1244-1247, або комплементарну їй полінуклеотидну послідовність. 20 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептид, що включає амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-29 (SEQ ID NO: 10) з одержанням біт показника BLAST принаймні 200, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700 або 750, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептид, що включає амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-29 (SEQ ID NO: 10) з одержанням біт показника BLAST принаймні 393, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-29 (SEQ ID NO: 10) з одержанням процентного значення ідентичності послідовності принаймні 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах процент ідентичності послідовності визначають при використанні способу універсального вирівнювання при використанні GAP алгоритму з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-29 (SEQ ID NO: 10) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 750, 800, 850, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990, 1000, 1010, 1020, 1030, 1040, 1050, 1060, 1070, 1080, 1090, 1100, 1110, 1120, 1130, 1140, 1150, 1160, 1170, 1180, 1190 або 1200, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-29 (SEQ ID NO: 10) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 1006, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-29 (SEQ ID NO: 10) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-60, e-70, e-75, e-80, e-85, e-90, e-95, e-100, e-105, e-106, e-107, e108, e-109, e-110, e-111, e-112, e-113, e-114, e-115, e-116, e-117, e-118, e-119, e-120 або e-125, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольований полінуклеотид кодує поліпептид, вибраний з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди включають полінуклеотидну послідовність SEQ ID NO: 434-832, 1214-1221, 1234-1239 або 1244-1247, або комплементарну їй полінуклеотидну послідовність. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептид, що включає амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-02 (SEQ ID NO: 3) з одержанням біт показника BLAST принаймні 200, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700 або 750, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-02 (SEQ ID NO: 3) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах процентне значення ідентичності послідовності визначають за допомогою способу універсального вирівнювання при використанні GAP алгоритму з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах 21 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-02 (SEQ ID NO: 3) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 750, 800, 850, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990, 1000, 1010, 1020, 1030, 1040, 1050, 1060, 1070, 1080, 1090, 1100, 1110, 1120, 1130, 1140, 1150, 1160, 1170, 1180, 1190 або 1200, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-02 (SEQ ID NO: 3) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-60, e-70, e-75, e-80, e-85, e-90, e-95, e100, e-105, e-106, e-107, e-108, e-109, e-110, e-111, e-112, e-113, e-114, e-115, e-116, e-117, e118, e-119, e-120 або e-125, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-02 (SEQ ID NO: 3) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-112, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольований полінуклеотид кодує поліпептид, вибраний з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди включають полінуклеотидну послідовність SEQ ID NO: 434-832, 12141221, 1234-1239 або 1244-1247, або комплементарну їй полінуклеотидну послідовність. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептид, що включає амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-07 (SEQ ID NO: 4) з одержанням біт показника BLAST принаймні 200, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700 або 750, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептид що включає амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-07 (SEQ ID NO: 4) з одержанням біт показника BLAST принаймні 388, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-07 (SEQ ID NO: 4) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-07 (SEQ ID NO: 4) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 93% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах процентне значення ідентичності послідовності визначають за допомогою способу універсального вирівнювання при використанні GAP алгоритму з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-07 (SEQ ID NO: 4) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 750, 800, 850, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990, 1000, 1010, 1020, 1030, 1040, 1050, 1060, 1070, 1080, 1090, 1100, 1110, 1120, 1130, 1140, 1150, 1160, 1170, 1180, 1190 або 1200, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-07 (SEQ ID NO: 4) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 996, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути 22 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-07 (SEQ ID NO: 4) з одержанням eзначення показника BLAST принаймні e-60, e-70, e-75, e-80, e-85, e-90, e-95, e-100, e-105, e-106, e-107, e-108, e-109, e-110, e-111, e-112, e-113, e-114, e-115, e-116, e-117, e-118, e-119, e-120 або e-125, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-07 (SEQ ID NO: 4) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-111, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольований полінуклеотид кодує поліпептид, вибраний з групи, що складається з SEQ ID NO: 3401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди включають полінуклеотидну послідовність SEQ ID NO: 434-832, 1214-1221, 1234-1239 або 12441247, або комплементарну їй полінуклеотидну послідовність. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептид що включає амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-20 (SEQ ID NO: 6) з одержанням біт показника BLAST принаймні 200, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700 або 750, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-20 (SEQ ID NO: 6) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-20 (SEQ ID NO: 6) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 93% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах процентне значення ідентичності послідовності визначають за допомогою способу універсального вирівнювання при використанні GAP алгоритму з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-20 (SEQ ID NO: 6) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 750, 800, 850, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990, 1000, 1010, 1020, 1030, 1040, 1050, 1060, 1070, 1080, 1090, 1100, 1110, 1120, 1130, 1140, 1150, 1160, 1170, 1180, 1190 або 1200, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-20 (SEQ ID NO: 6) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-60, e-70, e-75, e-80, e-85, e-90, e-95, e-100, e-105, e-106, e-107, e-108, e-109, e-110, e-111, e-112, e113, e-114, e-115, e-116, e-117, e-118, e-119, e-120 або e-125, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-20 (SEQ ID NO: 6) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e111, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольований полінуклеотид кодує поліпептид, вибраний з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди включають полінуклеотидну послідовність SEQ ID NO: 434-832, 1214-1221, 1234-1239 або 1244-1247, або комплементарну їй полінуклеотидну послідовність. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептид, що включає амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-44 (SEQ ID NO: 13) з одержанням біт показника BLAST принаймні 200, 250, 23 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700 або 750, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-44 (SEQ ID NO: 13) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-44 (SEQ ID NO: 13) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 93% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах процентне значення ідентичності послідовності визначають за допомогою способу універсального вирівнювання привикористанні GAP алгоритму з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-44 (SEQ ID NO: 13) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 750, 800, 850, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990, 1000, 1010, 1020, 1030, 1040, 1050, 1060, 1070, 1080, 1090, 1100, 1110, 1120, 1130, 1140, 1150, 1160, 1170, 1180, 1190 або 1200, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L1-44 (SEQ ID NO: 13) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e60, e-70, e-75, e-80, e-85, e-90, e-95, e-100, e-105, e-106, e-107, e-108, e-109, e-110, e-111, e-112, e-113, e-114, e-115, e-116, e-117, e-118, e-119, e-120, або e-125, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольований полінуклеотид кодує поліпептид, вибраний з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди включають полінуклеотидну послідовність SEQ ID NO: 434-832, 12141221, 1234-1239 або 1244-1247, або комплементарну їй полінуклеотидну послідовність. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептид, що включає амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L6-3A09 (SEQ ID NO: 1228) з одержанням біт показника BLAST принаймні 200, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, або 750, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептид, що включає амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L6-3A09 (SEQ ID NO: 1228) з одержанням біт показника BLAST принаймні 381, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L6-3A09 (SEQ ID NO: 1228) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах процентне значення ідентичності послідовності визначають за допомогою способу універсального вирівнювання при використанні GAP алгоритму з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L6-3A09 (SEQ ID NO: 1228) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 400, 425, 450, 475, 500, 24 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 750, 800, 850, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990, 1000, 1010, 1020, 1030, 1040, 1050, 1060, 1070, 1080, 1090, 1100, 1110, 1120, 1130, 1140, 1150, 1160, 1170, 1180, 1190 або 1200, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L6-3A09 (SEQ ID NO: 1228) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 978, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L6-3A09 (SEQ ID NO: 1228) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-60, e-70, e-75, e-80, e-85, e-90, e-95, e-100, e-105, e-106, e-107, e-108, e-109, e-110, e-111, e-112, e-113, e-114, e-115, e-116, e-117, e-118, e-119, e-120, або e-125, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L6-3A09 (SEQ ID NO: 1228) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-108, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольований полінуклеотид кодує поліпептид, вибраний з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 12061213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди включають полінуклеотидну послідовність SEQ ID NO: 434-832, 1214-1221, 1234-1239 або 1244-1247, або комплементарну їй полінуклеотидну послідовність. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептид, що включає амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L6-3H02 (SEQ ID NO: 94) з одержанням біт показника BLAST принаймні 200, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700 або 750, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L6-3H02 (SEQ ID NO: 94) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L6-3H02 (SEQ ID NO: 94) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 90% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах процентне значення ідентичності послідовності визначають за допомогою способу універсального вирівнювання при використанні GAP алгоритму з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L6-3H02 (SEQ ID NO: 94) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 750, 800, 850, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990, 1000, 1010, 1020, 1030, 1040, 1050, 1060, 1070, 1080, 1090, 1100, 1110, 1120, 1130, 1140, 1150, 1160, 1170, 1180, 1190 або 1200, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L6-3H02 (SEQ ID NO: 94) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-60, e-70, e-75, e-80, e-85, e-90, e-95, e-100, e-105, e-106, e-107, e-108, e-109, e-110, e-111, e112, e-113, e-114, e-115, e-116, e-117, e-118, e-119, e-120 або e-125, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольований полінуклеотид кодує поліпептид, вибраний з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах 25 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 ізольовані полінуклеотиди включають полінуклеотидну послідовність SEQ ID NO: 434-832, 12141221, 1234-1239 або 1244-1247, або комплементарну їй полінуклеотидну послідовність. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептид, що включає амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L7-4E03 (SEQ ID NO: 1229) з одержанням біт показника BLAST принаймні 200, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700 або 750, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептид, що включає амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L7-4E03 (SEQ ID NO: 1229) з одержанням біт показника BLAST принаймні 368, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L7-4E03 (SEQ ID NO: 1229) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах процентне значення ідентичності послідовності визначають за допомогою способу універсального вирівнювання при використанні GAP алгоритму з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L7-4E03 (SEQ ID NO: 1229) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 750, 800, 850, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990, 1000, 1010, 1020, 1030, 1040, 1050, 1060, 1070, 1080, 1090, 1100, 1110, 1120, 1130, 1140, 1150, 1160, 1170, 1180, 1190 або 1200, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L7-4E03 (SEQ ID NO: 1229) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 945, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L7-4E03 (SEQ ID NO: 1229) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-60, e-70, e-75, e-80, e-85, e-90, e-95, e-100, e-105, e-106, e-107, e-108, e-109, e-110, e-111, e-112, e-113, e-114, e-115, e-116, e-117, e-118, e-119, e-120 або e-125, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L7-4E03 (SEQ ID NO: 1229) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-105, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольований полінуклеотид кодує поліпептид, вибраний з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 12061213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди включають полінуклеотидну послідовність SEQ ID NO: 434-832, 1214-1221, 1234-1239 або 1244-1247, або комплементарну їй полінуклеотидну послідовність. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептид, що включає амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L10-84(B12) (SEQ ID NO: 1230) з одержанням біт показника BLAST принаймні 200, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700 або 750, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L10-84(B12) (SEQ ID NO: 1230) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності 26 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L10-84(B12) (SEQ ID NO: 1230) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 86% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах процентне значення ідентичності послідовності визначають при використанні способу універсального вирівнювання при використанні GAP алгоритму з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L10-84(B12) (SEQ ID NO: 1230) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 750, 800, 850, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990, 1000, 1010, 1020, 1030, 1040, 1050, 1060, 1070, 1080, 1090, 1100, 1110, 1120, 1130, 1140, 1150, 1160, 1170, 1180, 1190 або 1200, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L10-84(B12) (SEQ ID NO: 1230) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-60, e-70, e-75, e-80, e-85, e-90, e-95, e-100, e-105, e-106, e-107, e-108, e-109, e-110, e-111, e-112, e-113, e-114, e-115, e-116, e-117, e-118, e-119, e-120 або e-125, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольований полінуклеотид кодує поліпептид, вибраний з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди включають полінуклеотидну послідовність SEQ ID NO: 434-832, 1214-1221, 1234-1239 або 1244-1247, або комплементарну їй полінуклеотидну послідовність. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептид, що включає амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L13-46 (SEQ ID NO: 1231) з одержанням біт показника BLAST принаймні 200, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700 або 750, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептид, що включає амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L13-46 (SEQ ID NO: 1231) з одержанням біт показника BLAST принаймні 320, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L13-46 (SEQ ID NO: 1231) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 50% 60%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% або 99% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L13-46 (SEQ ID NO: 1231) з одержанням проценту ідентичності послідовності принаймні 86% ідентичності послідовності, де ідентичність послідовності визначають за допомогою BLAST вирівнювання при використанні BLOSUM62 матриксу, штрафу за існування розриву 11 та штрафу за подовження розриву 1. У деяких прикладах процентне значення ідентичності послідовності визначають за допомогою способу універсального вирівнювання при використанні GAP алгоритму з параметрами по умовчанню для % ідентичності амінокислотної послідовності та % подібності при використанні значення розриву 8 та значення довжини 2, а також BLOSUM62 матриці замін. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L13-46 (SEQ ID NO: 1231) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 750, 800, 850, 900, 910, 920, 930, 940, 950, 960, 970, 980, 990, 1000, 1010, 1020, 1030, 1040, 1050, 1060, 27 UA 105017 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 1070, 1080, 1090, 1100, 1110, 1120, 1130, 1140, 1150, 1160, 1170, 1180, 1190 або 1200, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L13-46 (SEQ ID NO: 1231) з одержанням показника BLAST подібності принаймні 819, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L13-46 (SEQ ID NO: 1231) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-60, e-70, e-75, e-80, e-85, e-90, e-95, e100, e-105, e-106, e-107, e-108, e-109, e-110, e-111, e-112, e-113, e-114, e-115, e-116, e-117, e118, e-119, e-120 або e-125, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, яка може бути оптимально вирівняна з поліпептидною послідовністю L13-46 (SEQ ID NO: 1231) з одержанням e-значення показника BLAST принаймні e-90, де BLAST вирівнювання використовує BLOSUM62 матрикс, штраф за існування розриву 11 та штраф за подовження розриву 1. У деяких прикладах ізольований полінуклеотид кодує поліпептид, вибраний з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди включають полінуклеотидну послідовність SEQ ID NO: 434-832, 12141221, 1234-1239 або 1244-1247, або комплементарну їй полінуклеотидну послідовність. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептид, що включає домен зв‘язування ліганду з поліпептиду, вибраного з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 12061213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди кодують SuR поліпептиди, що включають амінокислотну послідовність, вибрану з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243. У деяких прикладах кодований SuR поліпептид є вибраним з групи, що складається з SEQ ID NO: 3-401, 1206-1213, 1228-1233 або 1240-1243, а сполука сульфонілсечовини є вибраною з групи, що складається з хлорсульфурону, етаметсульфурон-метилу, метсульфурон-метилу, сульфометурон-метилу та тифенсульфурон-метилу. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди включають полінуклеотидну послідовність SEQ ID NO: 434-832, 1214-1221, 1234-1239 або 1244-1247, або комплементарну їй полінуклеотидну послідовність. У деяких прикладах ізольовані SuR полінуклеотид кодує SuR поліпептид, що має рівноважну константу зв‘язування для сполуки сульфонілсечовини більшу за 0,1 нМ та меншу за 10 мкM. У деяких прикладах кодований SuR поліпептид має рівноважну константу зв‘язування для сполуки сульфонілсечовини принаймні 0,1 нМ, 0,5 нМ, 1 нМ, 10 нМ, 50 нМ, 100 нМ, 250 нМ, 500 нМ, 750 нМ, 1 мкM, 5 мкM, 7 мкM, але меншу за 10 мкM. У деяких прикладах кодований SuR поліпептид має рівноважну константу зв‘язування для сполуки сульфонілсечовини принаймні 0,1 нМ, 0,5 нМ, 1 нМ, 10 нМ, 50 нМ, 100 нМ, 250 нМ, 500 нМ, 750 нМ, але меншу за 1 мкM. У деяких прикладах кодований SuR поліпептид має рівноважну константу зв‘язування для сполуки сульфонілсечовини більшу за 0 нМ, але меншу за 0,1 нМ, 0,5 нМ, 1 нМ, 10 нМ, 50 нМ, 100 нМ, 250 нМ, 500 нМ, 750 нМ, 1 мкМ, 5 мкМ, 7 мкМ, або 10 мкМ. У деяких прикладах сполука сульфонілсечовини являє собою сполуку хлорсульфурону, етаметсульфурону, метсульфурону, сульфометурону та/або тифенсульфурону. У деяких прикладах ізольовані SuR полінуклеотид кодує SuR поліпептид, що має рівноважну константу зв‘язування для послідовності оператора більшу за 0,1 нМ та меншу за 10 мкм. У деяких прикладах кодований SuR поліпептид має рівноважну константу зв‘язування для послідовності оператора принаймні 0,1 нМ, 0,5 нМ, 1 нМ, 10 нМ, 50 нМ, 100 нМ, 250 нМ, 500 нМ, 750 нМ, 1 мкМ, 5 мкМ, 7 мкМ, але меншу за 10 мкМ. У деяких прикладах кодований SuR поліпептид має рівноважну константу зв‘язування для послідовності оператора принаймні 0,1 нМ, 0,5 нМ, 1 нМ, 10 нМ, 50 нМ, 100 нМ, 250 нМ, 500 нМ, 750 нМ, але меншу за 1 мкМ. У деяких прикладах кодований SuR поліпептид має рівноважну константу зв‘язування для послідовності оператора більшу за 0 нМ, але меншу за 0,1 нМ, 0,5 нМ, 1 нМ, 10 нМ, 50 нМ, 100 нМ, 250 нМ, 500 нМ, 750 нМ, 1 мкМ, 5 мкМ, 7 мкМ або 10 мкМ. У деяких прикладах послідовність оператора являє собою послідовність Tet оператора. У деяких прикладах послідовність Tet оператора являє собою послідовність TetR(A) оператора, послідовність TetR(B) оператора, послідовність TetR(D) оператора, послідовність TetR(E) оператора, послідовність TetR(H) оператора або його функціональну похідну. У деяких прикладах ізольовані полінуклеотиди, що кодують SuR поліпептиди, включають профілі складу кодонів, що є характерними для переважності кодонів конкретних хазяйських 28