Похідні 2-аміно-, 6-фенілзаміщеного піридо[2,3-d]піримідину як інгібітори raf-кінази

Реферат: Відповідно до цього винаходу запропонована сполука, яка являє собою 1-(3,3-диметилбутил)-3(2-фтор-4-метил-5-(7-метил-2-(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6-іл)феніл)сечовину, або її фармацевтично прийнятна сіль, яка інгібує Raf і, отже, може бути корисною в лікуванні раку. UA 112340 C2 (12) UA 112340 C2 UA 112340 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 Сигнальний каскад Ras/Raf/мітоген-активована протеїнкіназа кіназа (також відома як MAP2K, МАРК кіназа і МАРК/ERK кіназа або МЕК)/екстрацелюлярна сигнал-регульована кіназа (ERK) (такий сигнальний каскад позначається в цьому документі як "Ras/Raf/MEK/ERK" або "Ras/Raf/MEK/МАРК") являє собою еволюційно консервативний шлях, який відіграє суттєву роль в розвитку і тканинному гомеостазі ссавців. Цей сигнальний шлях складається з кіназного каскаду, який передає екстрацелюлярні сигнали в ядро для регулювання експресії генів та ключових клітинних функцій. Експресія генів, контрольована сигнальним шляхом Ras/Raf/MEK/ERK, регулює основні клітинні процеси, включаючи проліферацію, диференціювання, апоптоз і ангіогенез. Ці різні ролі Ras/Raf/MEK/ERK сигналізації є аберантно активовними при раку різних типів. Мутації в генах в межах цього шляху можуть призвести до конститутивно активних білків з наслідковим посиленням проліферації клітин і стійкості до апоптозу. Raf (серин/треонін протеїнкіназа) кодується родиною генів, що складається з трьох генів, які дають три ізоформні члени родини Raf (B-Raf, C-Raf (Raf-1) і A-Raf). Кожен з цих білків має спільні висококонсервативні амінокінцеві регуляторні ділянки і каталітичні домени на карбоксильному кінці. Якщо не вказано інше, позначення Raf стосується всіх трьох членів. Незважаючи на те, що кожна ізоформа відіграє певну роль у шляху Ras/Raf/MEK/ERK, відомо, що саме B-Raf є основним активатором МЕК. B-Raf рекрутується Ras:GTP (гуанозин-5трифосфат) до внутрішньоклітинної мембрани, де відбувається активація B-Raf. У свою чергу, B-Raf відповідає за активацію MEK1/2, а MEK1/2 активує ERK1/ERK2. Мутації в гені B-Raf дозволяють B-Raf надсилати сигнал незалежно від висхідних сигналів. Як наслідок, мутований B-Raf білок (такий як V600E) викликає надмірну низхідну сигналізацію з боку МЕК і ERK. Це призводить до надмірної клітинної проліферації, виживаності клітин та онкогенезу. Надактивація сигнального каскаду мутованим B-Raf залучена до численних злоякісних новоутворень. Рецепторна тирозинкіназа (RTK) c-Kit (також відома як CD117) експресується на клітинах найрізноманітніших типів. Лігандом с-Kit є фактор стовбурових клітин (SCF). Зв'язування SCF з екстрацелюлярним доменом с-KIT індукує димеризацію рецептора і активацію низхідних сигнальних шляхів, в тому числі шляху RAS/RAF/MEK/ERK. Мутантний c-KIT є залучений до патогенезу раку деяких видів. Незважаючи на специфічні інгібітори B-Raf (наприклад, вемурафеніб (vemurafenib)) і сполуки, подібні розкритим в WO 2006/039718 і WO 2008/034008, існує потреба в інгібіторі Raf, активному щодо інгібування всіх ізоформ Raf білків, включаючи A-Raf, B-Raf, C-Raf і V600E мутацію B-Raf. Еснує також потреба в інгібіторі Raf, який є активним проти пухлинних клітин з активацією висхідного шляху мутаціями N-Ras, мутаціями K-Ras і мутаціями c-Kit. Крім того, залишається потреба в альтернативних інгібіторах Raf для лікування раку. Також залишається потреба в альтернативних інгібіторах Raf, активних при інгібуванні A-Raf, B-Raf, C-Raf і V600E мутації B-Raf для лікування раку. Відповідно, в цьому винаході запропонований інгібітор Raf, який може бути активним при інгібуванні всіх ізоформ Raf-білків. Крім того, в цьому винаході запропонований інгібітор Raf, який може бути активним проти пухлинних клітин з активацією висхідного шляху мутаціями N-Ras, мутаціями K-Ras і мутаціями c-Kit. Крім того, в цьому винаході запропонований альтернативний інгібітор Raf. Крім того, в цьому винаході запропонований альтернативний інгібітор Raf, який може бути корисним для лікування раку. Також у цьому винаході запропонований альтернативний інгібітор Raf, активний при інгібуванні A-Raf, B-Raf, C-Raf і V600E мутації B-Raf. На додаток до цього, в цьому винаході запропонований альтернативний інгібітор Raf, активний при інгібуванні A-Raf, B-Raf, C-Raf і V600E мутації B-Raf, який може бути корисним для лікування раку. На Фіг. 1 показана порошкова рентгенограма сполуки Прикладу 1. У цьому винаході запропонована сполука, що являє собою 1-(3,3-диметилбутил)-3-(2-фтор4-метил-5-(7-метил-2-(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6-іл)феніл)сечовину, або її фармацевтично прийнятна сіль. Як конкретний варіант здійснення в цьому винаході запропонована сполука, що являє собою 1-(3,3-диметилбутил)-3-(2-фтор-4-метил-5-(7-метил-2-(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6іл)феніл)сечовину. У цьому винаході запропонована фармацевтична композиція, яка містить 1-(3,3диметилбутил)-3-(2-фтор-4-метил-5-(7-метил-2-(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6іл)феніл)сечовину, або її фармацевтично прийнятну сіль, разом з фармацевтично прийнятним носієм. У цьому винаході запропонована фармацевтична композиція, яка містить 1-(3,3диметилбутил)-3-(2-фтор-4-метил-5-(7-метил-2-(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6іл)феніл)сечовину разом з фармацевтично прийнятним носієм. У цьому винаході запропонована фармацевтична композиція, яка містить 1-(3,3 1 UA 112340 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 диметилбутил)-3-(2-фтор-4-метил-5-(7-метил-2-(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6іл)феніл)сечовину, або її фармацевтично прийнятну сіль, і фармацевтично прийнятний носій, розріджувач або наповнювач. У цьому винаході запропонована фармацевтична композиція, яка містить 1-(3,3-диметилбутил)-3-(2-фтор-4-метил-5-(7-метил-2-(метиламіно)піридо[2,3d]піримідин-6-іл)феніл)сечовину і фармацевтично прийнятний носій, розріджувач або наповнювач. Як конкретний варіант здійснення в цьому винаході запропонована фармацевтична композиція, яка містить 1-(3,3-диметилбутил)-3-(2-фтор-4-метил-5-(7-метил-2(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6-іл)феніл)сечовину, або її фармацевтично прийнятну сіль, і співполімер полівінілпіролідону та вінілацетату (PVP-VA). Також у цьому винаході запропонована фармацевтична композиція, яка містить 1-(3,3-диметилбутил)-3-(2-фтор-4метил-5-(7-метил-2-(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6-іл)феніл)сечовину і співполімер полівінілпіролідону та вінілацетату (PVP-VA). Крім того, в цьому винаході запропоновані переважні варіанти здійснення фармацевтичних композицій, розкритих у цьому описі, де PVP® TM VA вибраний з групи, яку складають коповідон Kollidon VA 64 і коповідон Plasdone S-630. За ® варіантом, якому віддають перевагу, PVP-VA являє собою Kollidon VA 64. Композиція, якій наразі віддають перевагу, містить 1-(3,3-диметилбутил)-3-{2-фтор-4-метил5-[7-метил-2-(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6-іл]феніл}сечовину, або її фармацевтично ® прийнятну сіль, разом з Kollidon VA 64 (продукт компанії BASF Corporation, ą 95405-2-43), співполімером 1-вініл-2-піролідону і вінілацетату в співвідношенні 60:40, і 1-2 % (у масовому співвідношенні) лаурилсульфату натрію. Одержують тверду дисперсію, яка може містити 20 % або 40 % лікарського засобу і може включати 0-2 % лаурилсульфату натрію або відповідну кількість іншого придатного фармацевтично прийнятного зволожувального засобу, пластифікатора, речовини для поліпшення технологічних властивостей або іншого(-их) прийнятного(-их) наповнювача(-ів). Відповідно до цього винаходу запропонований спосіб лікування раку, що включає введення пацієнту, який цього потребує, ефективної кількості 1-(3,3-диметилбутил)-3-(2-фтор-4-метил-5(7-метил-2-(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6-іл)феніл)сечовини або її фармацевтично прийнятної солі. Відповідно до цього винаходу запропонований спосіб лікування раку, що включає введення пацієнту, який цього потребує, ефективної кількості 1-(3,3-диметилбутил)-3(2-фтор-4-метил-5-(7-метил-2-(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6-іл)феніл)сечовини. Відповідно до цього винаходу запропоновано 1-(3,3-диметилбутил)-3-(2-фтор-4-метил-5-(7метил-2-(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6-іл)феніл)сечовину або її фармацевтично прийнятну сіль для застосування в терапії. Відповідно до цього винаходу запропоновано 1-(3,3диметилбутил)-3-(2-фтор-4-метил-5-(7-метил-2-(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6іл)феніл)сечовину або її фармацевтично прийнятну сіль для застосування в лікуванні раку. Відповідно до цього винаходу запропоновано фармацевтичну композицію для застосування в лікуванні раку, і ця фармацевтична композиція містить 1-(3,3-диметилбутил)-3-(2-фтор-4-метил5-(7-метил-2-(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6-іл)феніл)сечовину або її фармацевтично прийнятну сіль. Відповідно до цього винаходу запропоновано 1-(3,3-диметилбутил)-3-(2-фтор-4-метил-5-(7метил-2-(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6-іл)феніл)сечовину для застосування в терапії. Відповідно до цього винаходу запропоновано 1-(3,3-диметилбутил)-3-(2-фтор-4-метил-5-(7метил-2-(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6-іл)феніл)сечовину для застосування в лікуванні раку. Відповідно до цього винаходу запропоновано фармацевтичну композицію для застосування в лікуванні раку, і ця фармацевтична композиція містить 1-(3,3-диметилбутил)-3(2-фтор-4-метил-5-(7-метил-2-(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6-іл)феніл)сечовину. Відповідно до цього винаходу запропоновано застосування 1-(3,3-диметилбутил)-3-(2-фтор4-метил-5-(7-метил-2-(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6-іл)феніл)сечовини або її фармацевтично прийнятної солі у виробництві лікарського засобу для лікування раку. Також відповідно до цього винаходу запропоновано застосування 1-(3,3-диметилбутил)-3-(2-фтор-4метил-5-(7-метил-2-(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6-іл)феніл)сечовини у виробництві лікарського засобу для лікування раку. Відповідно до цього винаходу запропоновано 1-(3,3-диметилбутил)-3-(2-фтор-4-метил-5-(7метил-2-(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6-іл)феніл)сечовину в кристалічній формі. Також відповідно до цього винаходу запропоновано 1-(3,3-диметилбутил)-3-(2-фтор-4-метил-5-(7метил-2-(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6-іл)феніл)сечовину в кристалічній формі, яка характеризується порошковою рентгенограмою, що має характеристичні піки, в одиницях 2θ±0,2, що спостерігаються при 16,0 і один або більше при 6,9, 7,0, 18,2 і 23,2. Крім того, відповідно до цього винаходу запропоновані переважні варіанти здійснення 2 UA 112340 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 способів і переважні варіанти застосування, розкриті в цьому описі, при цьому рак вибирають з групи, яку складають гострий мієлолейкоз (AML, гострий мієлоїдний лейкоз), хронічний мієлолейкоз (CML), хронічний лімфобластний лейкоз (CLL), мієлодиспластичний синдром, рак яєчника, меланома, дрібноклітинний рак легенів, недрібноклітинний рак легенів, колоректальний рак, рак підшлункової залози, рак передміхурової залози, рак печінки або рак щитовидної залози. За варіантом, якому віддають більшу перевагу, рак вибирають з групи, яку складають рак щитовидної залози, рак яєчників, меланома, гострий мієлобластний лейкоз (AML, гострий мієлоїдний лейкоз) і колоректальний рак. За варіантом, якому віддають ще більшу перевагу, згаданим раком є меланома або колоректальний рак. Спосіб лікування раку, яким є рак щитовидної залози, рак яєчника, меланома, AML або колоректальний рак, у пацієнта, цей спосіб включає введення пацієнту, який цього потребує, терапевтично ефективної кількості 1-(3,3-диметилбутил)-3-(2-фтор-4-метил-5-(7-метил-2(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6-іл)феніл)сечовини або її фармацевтично прийнятної солі. Сполука, що являє собою 1-(3,3-диметилбутил)-3-(2-фтор-4-метил-5-(7-метил-2(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6-іл)феніл)сечовину, або її фармацевтично прийнятна сіль для застосування в терапії. Сполука, що являє собою 1-(3,3-диметилбутил)-3-(2-фтор-4-метил-5-(7-метил-2(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6-іл)феніл)сечовину або її фармацевтично прийнятна сіль для застосування в лікуванні раку, яким є рак щитовидної залози, рак яєчника, меланома, AML або колоректальний рак. Застосування 1-(3,3-диметилбутил)-3-(2-фтор-4-метил-5-(7-метил-2-(метиламіно)піридо[2,3d]піримідин-6-іл)феніл)сечовини або її фармацевтично прийнятної солі для виготовлення лікарського засобу для лікування раку, яким є рак щитовидної залози, рак яєчника, меланома, AML або колоректальний рак. В конкретному варіанті здійснення фармацевтична композиція містить 1-(3,3-диметилбутил)3-{2-фтор-4-метил-5-[7-метил-2-(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6-іл]феніл}сечовину, або її фармацевтично прийнятну сіль, разом з фармацевтично прийнятним носієм і факультативно іншими терапевтичними інгредієнтами. У конкретному варіанті здійснення фармацевтична композиція містить 1-(3,3-диметилбутил)3-{2-фтор-4-метил-5-[7-метил-2-(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6-іл]феніл}сечовину, або її фармацевтично прийнятну сіль, разом з фармацевтично прийнятним носієм і факультативно іншими терапевтичними інгредієнтами, зокрема, для лікування раку в цілому або раку конкретного типу. Відповідно до цього винаходу запропонована сполука формули: або її фармацевтично прийнятна сіль. Термін "пацієнт" означає ссавця, а термін "ссавець" включає, але не обмежується цим, людину. Термін "терапевтично ефективна кількість" або "ефективна кількість" означає дозу сполуки або її фармацевтично прийнятної солі чи фармацевтичної композиції, що містить наведену як приклад сполуку або її фармацевтично прийнятну сіль, необхідну для інгібування сигналізації BRaf, C-Raf, A-Raf і/або B-Raf V600E в пацієнта, хворого на рак, і або знищення ракових клітинмішеней, або уповільнення чи зупинення розвитку раку в пацієнта. Очікувані дози наведеної як приклад сполуки або її фармацевтично прийнятної солі знаходяться в діапазоні від 300 мг на пацієнта за добу до 1500 мг на пацієнта за добу. Очікувані дози, яким віддають перевагу, знаходяться в діапазоні від 400 мг на пацієнта за добу до 1400 мг на пацієнта за добу. Очікувані дози, яким віддають найбільшу перевагу, знаходяться в діапазоні від 600 мг на пацієнта за добу до 1200 мг на пацієнта за добу. Точна доза, необхідна для лікування пацієнта, і тривалість періоду лікування визначатиметься лікарем з урахуванням стадії та тяжкості захворювання, а також специфічних потреб і реакції окремого пацієнта, а також конкретної введеної сполуки. Хоча базова доза на добу зазначена, схема приймання лікарського засобу може регулюватись, щоб забезпечити пацієнтові більш оптимальний терапевтичний ефект. На додаток до добової дози доцільним може бути введення дози двічі на добу (BID) або тричі на добу (TID). Наразі перевагу віддають дозуванню BID. Терміни "лікування" та "лікувати" включають в себе повний спектр втручання для раку, на 3 UA 112340 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 який страждає пацієнт, наприклад, введення активної сполуки для полегшення, уповільнення або звертання одного або більше симптому(-ів) раку і затримання прогресування раку, навіть якщо рак не є фактично ліквідованим. Наведену як приклад сполуку за цим винаходом виготовляють переважно у вигляді фармацевтичної композиції з використанням фармацевтично прийнятного носія або з використанням одного або більше фармацевтично прийнятного(-их) носія(-їв), розріджувача(-ів) або наповнювача(-ів), і вводять в організм пацієнта різноманітними шляхами. За варіантом, якому віддають перевагу, такі композиції призначені для перорального введення. Такі фармацевтичні композиції і способи їх одержання добре відомі в цій галузі техніки. Дивись, наприклад, REMINGTON: THE SCIENCE AND PRACTICE OF PHARMACY (A. Gennaro, et al., st eds., 21 ed., Mack Publishing Co., 2005). Сполука за цим винаходом, наведена як приклад, здатна реагувати з рядом неорганічних і органічних кислот з утворенням фармацевтично прийнятних солей, одержуваних за реакцією приєднання кислоти. Такі фармацевтично прийнятні солі та загальна методологія їх одержання добре відомі в цій галузі. Дивись, наприклад, Stahl, P., et al., HANDBOOK OF PHARMACEUTICAL SALTS: PROPERTIES, SELECTION AND USE, (VCHA/Wiley-VCH, 2002); Berge, S.M., et al., "Pharmaceutical Salts, “ Journal of Pharmaceutical Sciences, Vol. 66, No. 1, January 1977. Слід розуміти, що 1-(3,3-диметилбутил)-3-(2-фтор-4-метил-5-(7-метил-2(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6-іл)феніл)сечовина, або її фармацевтично прийнятна сіль, може бути одержана різноманітними способами, відомими в цій галузі, зокрема такими, які описані нижче. Сполука Прикладу 1 має назву 1-(3,3-диметилбутил)-3-{2-фтор-4-метил-5-[7-метил-2(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6-іл]феніл}сечовина; а також може має назву N-(3,3диметилбутил)-N’-[2-фтор-4-метил-5-[7-метил-2-(метиламіно)піридо[2,3d]піримідин-6іл]феніл]сечовина; для однозначної ідентифікації сполуки Прикладу 1 також можуть бути застосовані інші назви. Сполуки, використані як вихідні матеріали в синтезі 1-(3,3-диметилбутил)-3-(2-фтор-4-метил5-(7-метил-2-(метиламіно)піридо[2,3-d]піримідин-6-іл)феніл)сечовини, добре відомі і, у разі відсутності в продажу, легко синтезуються із застосуванням наданих конкретних посилань стандартними процедурами, які зазвичай застосовуються пересічними фахівцями в цій галузі, або які можна знайти в загальних довідкових текстах. Приклади відомих процедур і методів включають описані в загальних довідкових текстах, наприклад, Comprehensive Organic Transformations, VCH Publishers Inc, 1989; Compendium of Organic Synthetic Methods, Volumes 1-10, 1974-2002, Wiley Interscience; Advanced Organic th Chemistry, Reactions Mechanisms, and Structure, 5 Edition, Smith, Michael B. and March, Jerry, th Wiley Interscience, 2001; Advanced Organic Chemistry, 4 Edition, Part B, Reactions and Synthesis, Carey, Francis A. and Sundberg, Richard J., Kluwer Academic/Plenum Publishers, 2000 тощо, і в наведених у них посиланнях. Наведені нижче терміни, вжиті в цьому описі, "d6-DMSO" означає гексадейтеродиметилсульфоксид; "DCM" означає дихлорметан; "DMSO" означає диметилсульфоксид; "EtOAc" означає етилацетат; "EtOH" означає етанол; "HPLC" означає високоефективну рідинну хроматографію; "IPAC" означає ізопропілацетат; "KF" означає Карл Фішер (Karl Fisсher); "MS" означає мас-спектроскопію; "MeOH" означає метанол; "MTBE" означає трет-бутилметиловий простий ефір; "ЯМР" означає ядерний магнітний резонанс; "RT" означає кімнатну температуру; "THF" означає тетрагідрофуран. Якщо не зазначено інше, сполуки, наведені в цьому описі, називаються і нумеруються з використанням ACDLABS або Symyx Draw 3.2. Препаративна методика 1 5-бром-2-фтор-4-метиланілін Спосіб А: 1-бром-4-фтор-2-метилбензол (30,0 г, 159 ммоль) змішують з концентрованою сірчаною кислотою (100 мл), охолоджують до температури приблизно -5 °C, і краплями обробляють азотною кислотою (11,00 мл, 174 ммоль) протягом 20 хв. Реакційну суміш лишають для нагрівання до кімнатної температури, і перемішують протягом 30 хв. Виливають на подрібнений лід з перемішуванням, і розподіляють за допомогою трет-бутилметилового простого ефіру (MTBE) (200 мл). Водний шар відокремлюють, і екстрагують МТВЕ (250 мл). Органічні шари об'єднують, сушать і концентрують при зниженому тиску до одержання 1-бром-4-фтор-2-метил 4 UA 112340 C2 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 5-нітробензолу у вигляді в'язкого масла помаранчевого кольору (39,0 г). Неочищений 1-бром-4-фтор-2-метил-5-нітробензол (32,4 г, 138 ммоль), етанол (100 мл) і нікель Ренея (1,00 г, 17,04 ммоль) об'єднують в шейкерній колбі. Цю колбу заповнюють воднем (275 кПа), і перемішують до припинення поглинання водню. Тиск в реакційній посудині зменшують, каталізатор відфільтровують, і фільтрат упарюють досуха. Додають MTBE, знову фільтрують, і фільтрат упарюють. Залишок перемішують у гексанах. Тверді речовини відфільтровують, промивають холодними гексанами, сушать in vacuo, і одержують вказану в заголовку сполуку (17,8 г, вихід 63 %) у вигляді твердої речовини темного кольору. MS (m/z): 204,0 (М+1)/206,0 (M+3). Метод B: До 4-горлої круглодонної колби, спорядженої механічною мішалкою, термометром, льодяною банею і отвором для впуску N2, додають 1-бром-4-фтор-2-метилбензол (1,4 кг, 7,4 моль), після чого при температурі 0-10 °C додають концентровану H2SO4 (6,3 кг). Після перемішування протягом 10-20 хв, суміш охолоджують до температури -10-0 °C, і порціями протягом приблизно 6 год. додають KNO3 (0,82 кг, 7,8 моль, 1,05 екв.), підтримуючи температуру на рівні -10-0 °C. Після додання реакційну суміш нагрівають до температури 1020 °C, і перебіг реакції контролюють засобами тонкошарової хроматографії (EA (етилацетат):PE (петролейний простий ефір)=1:20) і HPLC, доки вміст 1-бром-4-фтор-2-метилбензол на становитиме